结核病是世界上最古老，分布最广的传染病之一，主要由结核分枝杆菌引起，多发生在肺部。我国是全球22个结核病高负担国家之一，防治形势严峻。我国的结核病疫情主要有以下四个特点:1）感染人数多，我国约有5亿人感染过肺结核;2）患者人数多，我国现有活动性肺结核患者约450万，占全世界结核患者总数的16％;3）农村结核病人多，据全国第五次结核病流调结果显示，我国农村地区的肺结核患者约占我国全部肺结核病人数的80％;4）耐药病人多，尤其是耐多药和广泛耐药的病人数多，我国每年约新发耐多药结核12.1万例。　　控制结核病，要从发现结核病人并控制其传播入手。虽然我国已经完成了STOP TB会议提出的目标，即在2005年达到至少70％的涂阳结核病人发现率和85％的涂阳病人治愈率，但是较高的涂阳病人发现率和治愈率并没有让我国结核病的总体患病率大幅下降。在过去的10年内，尽管我国涂阳病人的患病率已经下降了60.9％，但活动性肺结核病人的总体患病率仅从2000年的466人/10万人下降至2010年的459人/10万人，仅减少了1.5％，速度十分缓慢。说明我国在结核病人，特别是涂阴病人的发现方面仍然存在一定问题，加之我国结核病疫情存在的地区差异，我们急需了解高患病率的农村地区的结核病人发现情况。　　本篇论文的第一章介绍了在四川省武胜县旧胜利镇开展的结核病横断面研究，目的在于了解并获得我国农村地区真实的结核病患病率和活动性结核病人发现率。我们选择了旧胜利镇14个自然村的大于等于15岁以上的居民作为研究对象，利用国家结核病申报系统查询2008年1月-2013年11月该地区活动性结核病人的报告数。使用主动发现病人的方法，对每一个居民进行结核病症状筛查，找出疑似结核病人，再使用X光检查、痰涂片镜检、痰培养和GeneXpert分子检测等四种方法对疑似病人进行筛查，确认活动性结核病人，最后计算该地区的结核病患病率和研究开展期间的结核病病例报告率，并与既往数据进行比较。研究结果显示，在实际筛查的5064名户籍人口中，有538名疑似结核病人和10名正在接受治疗的结核病人，在538名疑似病人中，有25名确诊为活动性肺结核病人。则该地区在研究期间的病例报告率约为494人/10万人，患病率约为690人/10万人。所获得的病例报告率分别约是该地区前5年同时期和2013年同时间跨度的3-6倍和2.8-3.6倍，说明该地区通过被动发现方式只能找到主动发现所能发现的病人数的16％-36％，提示结核病人的发现还存在问题，还需要新的方法提高病人的发现率。　　耐药结核病也是结核病防治中的另一重要问题。根据2008年的全国耐药基线调查显示，我国涂阳肺结核患者总耐药率为37.8％，其中初治涂阳肺结核患者总耐药率为5.16％，复治涂阳肺结核患者总耐药率为55.2％，均高于全球平均水平。2010年我国约有6万耐药肺结核病人，占全球总病人数的27％，仅次于印度。因为耐药结核病人相对普通结核病人更难被发现且传染性更高，若未被及时发现并治疗，会传染更多的病人，导致严重的耐药结核病疫情。由于目前我们已经开始使用快速诊断方法（主要是基因型耐药检测方法）发现耐药结核病人，因此，我们还需了解快速诊断方法的优劣，进一步改善快速诊断方法对耐药结核病人的诊断准确性和预测能力。　　本篇论文的第二章研究分析了异质性耐药现象对结核分枝杆菌基因型耐药检测结果的影响。研究选择了上海市疾病预防控制中心(SCDC)在2009年收集的80株氧氟沙星临床耐药菌株，首先利用基因测序检测以上菌株在gyrA和gyrB耐药决定区基因突变情况，再使用分子克隆和荧光定量PCR探针熔解曲线法分析经基因测序未检测到耐药突变的菌株中是否存在异质性耐药现象。结果发现，80株氧氟沙星耐药菌株中有15株未发现已知的gyrA或gyrB耐药决定区的基因突变，其中有14株菌株含有已知的gyrA耐药突变，即存在异质性耐药现象。纳入发生异质性耐药的菌株后，基因型与表型耐药检测的符合率81.25％(65/80)提高到98.75％(79/80)。说明异质性耐药是导致表型和基因型耐药检测结果不符的重要原因。为了排除异质性耐药对耐药基因检测的影响，提高基因型与表型耐药检测结果的一致性，需要开发应用更灵敏的基因型耐药检测技术，提高耐药结核病快速检测的水平。　　在本篇论文的第三章，为了了解基因型耐药检测对菌株耐药水平的预测程度，研究分析了gyrA/B基因上的相关耐药突变与结核分枝杆菌临床菌株对氟喹诺酮类药物的耐药程度的关系。该部分研究使用显微镜直视下药物敏感性检测技术（MODS法）测量了第二章中SCDC所发现的80株氧氟沙星耐药菌株对氧氟沙星、莫西沙星和加替沙星的最低抑菌浓度(MIC)，并结合菌株的耐药基因突变情况，进一步统计分析MIC与耐药突变类型的关系。发现在gyrA基因上发生A90V和D94A突变的菌株对氟喹诺酮类药物的MIC水平普遍较低，发生D94G和D94N突变的菌株对氟喹诺酮类药物的MIC水平普遍较高，并存在统计学意义。说明gyrA基因上的A90V和D94A突变与菌株对氟喹诺酮类药物的低水平耐药有关，D94G和D94N突变与菌株对氟喹诺酮类药物的高水平耐药有关，提示在对氧氟沙星耐药病人进行治疗前，有必要通过耐药快速诊断了解病人菌株的突变情况，以选择最优的用药方案。　　以上研究提示，我国仍需改善结核病人的发现方法和实验室诊断技术，进一步提高活动性结核病人的发现率;对于耐药结核病人，需要提高基因型耐药检测等快速诊断手段的灵敏度，及时发现耐药病人;另外要利用快速诊断对病人的耐药水平进行合理预测，调整病人的用药和治疗方案。这样才能有的放矢地制定结核病防治策略，有效利用公共卫生和医疗资源，达到控制结核病的目的。