CDK2和CDK4在肿瘤相关巨噬细胞促进卵巢癌SKOV-3细胞增殖过程中发挥作用的研究

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jp19861213
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卵巢癌组织、腹水、腹膜中存在大量极化的M2型肿瘤相关巨噬细胞(Tumor-Associated Macrophages,TAMs)深入研究M2-TAMs在卵巢癌发生发展中的重要作用,有可能为卵巢癌的治疗提供新的线索。各种组学技术蓬勃发展,如何从其产生的海量生物学数据中提取有价值的生物学信息,是生物学家面临的一个严峻挑战。  利用全基因组表达谱芯片技术获得了TAMs作用下卵巢癌SKOV3细胞内表达发生变化的996个基因,进一步利用PPI network和差异表达基因构建TAMs对SKOV3细胞作用网络。之后利用CFinder软件对该网络进行模块识别,共识别出4个模块。利用David软件对每个模块进行功能注释,发现模块1基因主要与肿瘤发生及细胞周期相关。利用cytoscape software对模块1中的31个基因构建genes-functions visualization network,发现4个基因蛋白(E2F1,RB1,CDK2,CDK4)功能活跃。通过对这4个蛋白功能相关的研究进展进行综合分析,最终推测出CDK2和CDK4可能是TAMs对SKOV3细胞作用网络中起关键调控作用的基因,值得深入研究。在进一步的分子生物学实验验证中,首先利用Westernblot和激酶活性检测的方法证实了TAMs能明显增强SKOV3细胞中CDK2 andCDK4的表达和活性。之后利用CDK2、CDK4激酶抑制剂,采用3H-TdR incorporation法及流式细胞术对不同条件下SKOV3细胞的增殖和细胞周期分布进行了检测,证实CDK2、CDK4在TAMs促进SKOV3细胞自G1期向S期转化,进而促进细胞增殖过程中发挥着重要的作用。  本研究在构建了TAMs作用下卵巢癌SKOV3细胞特异性基因表达谱的基础上,探寻了一种基因表达谱数据的分析方法,获得的研究结果,可以为后续的分子实验设计提供有效的指导。
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