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硫酸盐还原菌（sulfate reducing bacteria, SRB）是类以硫酸盐为呼吸链终端电子受体从而氧化有机物和氢气以获取能量的类厌氧微生物。硫酸盐还原菌不仅抑制酸盐的产生，而且消耗肠道内已有的酸盐；硫酸盐还原菌的主要产物之是硫化氢（H2S），它调节胰岛素的分泌、抑制酸盐的氧化、影响动物细胞的呼吸、对动物细胞有遗传毒性和细胞毒性；革兰氏阴性菌硫酸盐还原菌的脂多糖（lipopolysaccharide，LPS）诱发炎症的能力强。硫酸盐还原菌的这些特性都表明它可能是肠道内具有重要功能