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葡萄为葡萄科(Vitaceae)葡萄属(Vitis)多年生落叶藤本植物，是起源最古老的植物之一。新疆在我国葡萄产业中占有重要的地位，针对新疆夏季气候干旱，冬季气候寒冷，土质盐碱化严重的情况，近年来引入抗旱、抗寒及抗盐碱的砧木葡萄品种，采用嫁接栽培的方式来达到葡萄提质增产的效果。影响嫁接成活的基本条件是砧木与接穗的亲和性，如何选择不同抗性砧木以及判断砧木是否与接穗品种亲和性好是进行嫁接栽培时的关键，也是目前葡萄产业发展亟待解决的问题。因此，本研究以新疆近年来主要引进的葡萄砧木品种和生产上主要的栽培葡萄品种为研究对象，在进行表型多样性分析的基础上，进一步通过ISSR分子标记鉴定其亲缘关系，期望为适宜砧穗组合的选择、利用和开发提供一定的科学依据和参考。主要研究结果如下：
1．通过对葡萄表型指标的观测，发现48份材料的9个数量性状的Simpson指数变化范围在0.98～1.04之间，Shannon-weaver指数的变化范围在5.50～5.56之间。9个数量性状的变异系数较大，均超过20%，其中叶片厚度变异系数(0.39)最大，叶片SPAD值变异系数(0.20)最小。在欧氏距离20.0处，供试48份材料被分成3类。9个形态指标中叶片纵径、叶片横径、节间长度和叶柄长度是葡萄进行表型观测时的重要指标。
2．以新疆不同葡萄品种DNA为模板，采用均匀设计法，对影响ISSR-PCR体系的Mg2+、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶等进行了U20(54)和U12(34)两轮优化，并在此基础上对退火温度及循环数进行了摸索。优化后的25μL反应体系包含2.5mmol/LMg2+，2.0mmol/LdNTPs，1.0μmol/L引物，2.50UTaqDNA聚合酶及1.0μmol/L模板DNA。PCR程序中筛选的最佳退火温度为54.8℃。最佳循环次数为35个循环，采用优化后的程序既满足试验产物得率，又节省试验的时间。
3．通过使用ISSR分子标记技术研究新疆48个葡萄品种的遗传多样性，发现8条引物共扩增出50条带，其中多态性条带44条，平均多态性位点百分率为88%。48份葡萄平均有效等位基因数(Ne)为1.5593，平均Neis基因多样性指数(H)为0.3229，平均Shannons信息指数(I)为0.4780。
4．利用NTSYS-pc2.10t软件进行相似性系数分析，48份品种的遗传相似系数在0.21～0.93，平均遗传相似系数为0.5153。通过遗传关系树状图表明，在遗传相似系数为0.50处48份葡萄材料被分为4个类群。
1．通过对葡萄表型指标的观测，发现48份材料的9个数量性状的Simpson指数变化范围在0.98～1.04之间，Shannon-weaver指数的变化范围在5.50～5.56之间。9个数量性状的变异系数较大，均超过20%，其中叶片厚度变异系数(0.39)最大，叶片SPAD值变异系数(0.20)最小。在欧氏距离20.0处，供试48份材料被分成3类。9个形态指标中叶片纵径、叶片横径、节间长度和叶柄长度是葡萄进行表型观测时的重要指标。
2．以新疆不同葡萄品种DNA为模板，采用均匀设计法，对影响ISSR-PCR体系的Mg2+、dNTPs、引物、TaqDNA聚合酶等进行了U20(54)和U12(34)两轮优化，并在此基础上对退火温度及循环数进行了摸索。优化后的25μL反应体系包含2.5mmol/LMg2+，2.0mmol/LdNTPs，1.0μmol/L引物，2.50UTaqDNA聚合酶及1.0μmol/L模板DNA。PCR程序中筛选的最佳退火温度为54.8℃。最佳循环次数为35个循环，采用优化后的程序既满足试验产物得率，又节省试验的时间。
3．通过使用ISSR分子标记技术研究新疆48个葡萄品种的遗传多样性，发现8条引物共扩增出50条带，其中多态性条带44条，平均多态性位点百分率为88%。48份葡萄平均有效等位基因数(Ne)为1.5593，平均Neis基因多样性指数(H)为0.3229，平均Shannons信息指数(I)为0.4780。
4．利用NTSYS-pc2.10t软件进行相似性系数分析，48份品种的遗传相似系数在0.21～0.93，平均遗传相似系数为0.5153。通过遗传关系树状图表明，在遗传相似系数为0.50处48份葡萄材料被分为4个类群。