水稻灌浆期叶片衰老期间miRNA高通量测序及生物信息学分析

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水稻(Oryza sativa)产量是保证人类粮食安全的重中之重。延缓水稻叶片衰老,延长光合作用的时间是提高水稻产量的途径之一。MicroRNAs(miRNAs)是真核生物衰老以及细胞衰老的重要调节因子。  本研究为了解miRNA在水稻叶片衰老中的生物学作用,通过对两种超级杂交稻内2优6(N2Y6,抗衰老水稻)和两优培9(LYP9,易衰老水稻)叶片的六个小RNA文库,六个RNA序列库以及两个降解组库进行高通量测序,报导了与衰老相关的miRNA和他们的靶基因。研究发现在共有372个已知miRNA,162个候选miRNA以及1145个靶基因被确定。通过与LYP9叶片中miRNA的表达量相比,在N2Y6籽粒灌浆期的早期上调和下调的miRNA分别为47和30,在中期分别为21和17,在后期分别为11和37。osa-miR159、osa-miR160、osa-miR164、osa-miR167、osa-miR172以及osa-miR1848六个miRNA家族的靶基因分别编码APETALA2(AP2)、锌指蛋白、水杨酸诱导蛋白19(SIP19)、生长素响应因子(ARF)和NAC转录因子,这些转录因子已报导通过激素信号转导通路参与叶片的调节。这些结果为了解miRNA介导水稻叶片的衰老提供了有价值的信息,并为水稻育种提供了重要的依据。miRNA对于植物的逆境胁迫有着重要的调节作用。为验证miRNA与盐胁迫的关系,对处于盐胁迫状态下6小时的两种超级杂交稻取样,盐胁迫的浓度梯度,为0mM、50mM、100mM、150mM、200mM,并且随机选取 miRNA166、miRNA160e、miRNA159、miRNA1320、miRNA396、miRNA167以及miRNA159c共7个miRNA进行定量PCR分析。除miRNA166和miRNA160e,其它5个miRNA均与已报导过的miRNA介导盐胁迫过程中定量PCR结果相同,因此确定这5个miRNA与调控水稻叶片盐胁迫相关。选取miRNA159,miRNA1320以及他们的靶基因LOC_Os01g59660.1和LOC_Os12g42220.1构建GFP,过表达以及敲除重组载体以待进一步研究其具体功能。
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