金融是现代经济的核心，而资金配置是金融的核心功能，在产业转型的过程中，无论是增量调整还是存量调整，都离不开大量的资金支持和金融系统的有效调控。从资金配置的角度分析金融结构对产业结构变动的影响，对于推动产业结构调整具有重要意义。本文从金融系统的资金配置角度出发，从金融总量结构和金融内部结构两方面入手，以北京市的数据为依据，分析金融结构对产业结构变动的影响。具体来说，取金融相关比率代表金融总量结构、银行信贷市场比例、保险市场比例代表资金间接配置功能、股票市场比例代表资金直接配置功能，对这四个指标与三次产业增加值占GDP的比重之间的关系进行实证分析，得到如下结果：金融相关比率与第一产业比值、第二产业比值和第三产业比值之间都存在长期协整关系，且金融总量的增长会推动第三产业比值的提高，降低第一和第二产业在国民生产中的比重，从而促进北京市产业结构的调整；银行信贷资金配置比例与第三产业比值之间存在长期协整关系，但与第一产业比值和第二产业比值之间不存在稳定的长期协整关系；保险市场比例与三次产业比例均不存在长期协整关系；证券市场资金配置比例与第二产业比值、第三产业比值之间具有长期协整关系，但与第一产业比值之间不存在这种关系。基于以上实证分析的结果，本文提出相应的政策建议，积极推进金融产业发展，优化金融生态，改善金融环境，强化银行信贷市场证券市场的资金配置功能等。