本论文使用电喷雾质谱（ESI-MS）对16个在2和6位置分别含有α或β天冬氨酸（Asp）的7肽在低能量的碰撞下形成的碎片离子进行了分析,目的在于发展低能量质谱的分析方法区分肽中存在天冬氨酸异构体。在低能量碰撞活化分解（CAD）条件下,16个分别含有α和β天冬氨酸的7肽主要产生b, y, b-H₂O, a, M和M-H₂O离子。当肽段中的α– Asp被β– Asp取代我们观察到:1) bn-H₂O/bn （n: 2 - 5）的值增加,而M+H-H₂O/M+H的值降低。因此我们首次提出用bn-H₂O/bn （n : 2 - 5）和M+H-H₂O/M+H区分Asp的同分异构体。但是利用这两组比值不能确定天冬氨酸异构体在肽段序列中的位置。2)bn/yl-n （n: 2 - 5）的比值减小。Lehmann等曾提出利用Asp相邻肽键断裂产生的b, y离子比值（即bn-1/yl-n+1,bn/yl-n）区分α– Asp和β– Asp不同。我们的研究结果显示bn/yl-n （n: 2 - 5）比值的减小与天冬氨酸的位置无关。靠近碳端的b₆/y1受到端基和序列的影响,b₆-H₂O/b₆受序列不同的影响,不能用于区分Asp的同分异构体。上述实验结果表明,b, y, b-H₂O, M+H-H₂O离子的形成可能是几种机理相互竞争共同作用的结果,其确切的形成机理还有待于进一步的研究。其次又分别使用电喷雾离子阱串联质谱和电喷雾四级杆串联质谱对加入一7肽的[M+Na]+产生的碎片进行分析。通过实验我们提出用含有α- Asp的肽产生的特征峰bn+Na+OH区分端基未修饰和氮端乙酸化的肽段中邻近碳端的α- Asp和β- Asp。但这种特征峰不能区分邻近氮端的α- Asp和β- Asp。