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菜籽粕是我国最丰富的植物源蛋白之一,其蛋白质含量在28%-44%。菜粕中氨基酸组成平衡,因此可作为蛋白质饲料,应用于畜禽日粮中,替代大豆粕,以降低饲料及饲养成本。但菜籽粕中存在的硫甙、单宁及纤维素等有毒物质和其它抗营养因子严重影响了菜粕饲用价值。本研究采用微生物发酵法去除菜籽粕中的硫甙等有毒物质,同时利用微生物生长代谢所产生的各种蛋白酶,将菜籽蛋白分解为更易被畜禽吸收利用的多肽物质,从而提高菜籽粕的利用率和营养价值。课题从实验室分离保减的79株菌株出发,定向筛选出对硫甙有较好降解作用的ndt、Br、Zf1等8株优良菌株;同时从44株对纤维素有一定降解作用的菌株中,筛选得到具有高纤维素酶活的菌株Z4。优化组合上述复筛得到的9株菌,确定最佳的混菌发酵组合为:ndt+Br+Zf1,其中ndt为枯草芽胞杆菌（Bacillus subtilis）、Br为蜡质芽胞杆菌（Bacillus cereus）、Zf1为干酪乳杆菌（Lactobacillus casei）;通过正交实验确定了3菌的最佳接种比例Zf1:Br:ndt为3:2:1。在发酵条件单因素试验基础上,通过4因素3水平正交实验,得到最佳的混菌发酵条件:料水比1:0.8,pH自然,温度30℃,时间48 h。试验还研究了添加外源物质对菜粕混菌发酵的影响,其中添加0.2%FeSO4和10%棉粕对菜粕混菌发酵有促进作用。以硫甙降解率、粗蛋白含量和小肽含量提高率3个指标为因变量,以棉粕添加量、发酵温度、料水比、发酵时间为自变量,设计响应面实验（Response serface method.RSM）,分别得到各自的最佳发酵条件。5次重复试验结果表明:粗蛋白含量为40.91%,较发酵前提高了13.5%;小肽含量较发酵前提高了403.12%;硫甙降解率达到70.28%;单宁降解率达31.16%。对提取后的菜籽蛋白Tricine-SDS-PAGE分析表明,发酵后的蛋白组分分子量绝大部分均小于20 kD;发酵后小分子量蛋白组分明显增多;辅助凝胶过滤结果后发现发酵后的蛋白在7 kD的组分占总组分菜籽蛋白的81.01%,而原料菜粕则检测不出。发酵后菜粕有益活菌数达到6.80×108CFU/g。通过本工艺发酵,菜粕作为饲料蛋白质原料的品质得到有效改善。