我国目前正处于结构性减速的经济新常态时期,国家经济面临着转型升级与持续发展的双重挑战。以创新促进全要素生产率的提升,再造经济发展的新动力,成为目前我国经济发展的重要任务。新三板作为我国资本市场的重要组成部分,为了稳定和吸引优质人才,鼓励管理层的创新投入和核心员工的创新实践,促进技术创新水平的提升,实施了股权激励。但是这种股权激励对于技术创新的促进效应并不明显。实践中这类企业的股权激励究竟应该怎么实施,如何设计才更有效,都是亟待解决的问题。基于此,本文首先通过梳理国内外相关文献、介绍股权激励的制度背景以及新三板股权激励的实践现状,阐明目前我国新三板企业股权激励的特殊性。然后在理论分析的基础之上,选取新三板市场中多家实施股权激励的高新技术企业作为研究对象,通过对比研究它们的激励模式、激励对象、激励数量等方案要素,结合企业的技术创新表现,发现其股权激励的不足并据此提出对于技术创新导向的股权激励方案的优化建议。通过本文的研究发现,有效的股权激励能够切实促进企业的技术创新,但是股权激励对象选择不当、股权激励数量不适宜以及绩效考核指标欠缺等都会影响企业的技术创新,企业应该结合自身的实际情况,设计有效的激励方案要素,促进企业技术创新水平的提高。