Biosafood-8食源性致病菌检测基因芯片的研制初探

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食品安全,关系到国计民生。食物中毒,是当前危害人体健康和威胁我国经济发展的一个严重问题,其中细菌性食物中毒是一个重要组成部分。基因芯片作为一个新兴的生命科学技术,与传统的检测法相比,它具有高通量、易自动化等特点,用于病原体的检测,具有极大的市场竞争力和开发应用前景。导致食物中毒的食源性致病菌的种类很多,本课题拟选择广东省比较常见的8种食源性致病菌用于检测基因芯片的研制,它们分别是大肠埃希菌、沙门氏菌、志贺氏菌、空肠弯曲菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌、金黄色葡萄球菌和单增李斯特菌。将针对这8种食源性致病菌研制的oligo检测基,因芯片命名为“Biosafood-8芯片”。 1.初步研制了LM芯片和Biosafood-8芯片。LM芯片是一个用于芯片研制路线探索与试验的中间产品;Biosafood-8芯片为一个能检测广东省常见的8个种属食源性致病菌的检测型基因芯片的原型,是本课题的目标产品。 2.通过LM芯片的样品检测实验发现:IDT合成的70mer oligo芯片探针在芯片打印与芯片检测两个方面都优于上海生工合成的探针。比较10μM、40μM和80μM三个oligo探针点样浓度,结果显示10μM的探针点样浓度也能获得很好的芯片检测结果。 3.通过LM芯片和Biosafood-8芯片的样品检测充分证实了本课题芯片研制路线是可行的。本课题优化的芯片检测路线获得了良好的芯片检测结果。 4.用LM芯片检测LM样品进行的检测重复性和灵敏度实验显示,用本课题设计的oligo基因芯片技术方案和路线研制的基因芯片具有较好的重复性,样品检测绝对量的初步下限为0.9ng DNA。 5.用本课题研制Biosafood-8芯片检测18个不同种属来源的已知参考生物样品,从8个亚阵列构成的全阵列和芯片上每一个亚阵列两个不同的角度,都证实该芯片能够通过集成的8个目标菌检测探针亚阵列,在整体芯片阵列水平,清晰而又明确地区分目标致病菌样品和非目标致病菌样品,特异而又准确的显示被检测的目标菌样品的种属。
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