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[背景与目的]结直肠癌是临床常见恶性肿瘤之一,根治性切除术后的患者有近半数会复发和转移,而复发和转移是导致患者预后不良和死亡的最主要原因,结直肠癌患者最常见的远处转移器官是肝脏。基因组DNA的非随机改变在结直肠癌的发生发展中起重要的作用。本研究通过寡核苷酸array CGH分析结直肠腺癌新鲜组织标本,寻找结直肠癌肝转移特异的DNA改变,筛选出可能与肝转移预后密切相关的DNA拷贝数改变和相应的基因。[材料与方法]收集2006年6月至2006年12月结直肠癌患者根治性切除肿瘤组织标本16例,提取基因组DNA,通过array CGH分析,鉴定结直肠癌的基因拷贝数改变。收集2006年-2007年间根治性切除的结直肠癌120例,构建组织芯片应用免疫组织化学(IHC)方法检测cortactin、HSP70、Ki67、Mcm7、p53、β-catenin、PTP-1βDNAJB6蛋白的表达情况,分析其与肝转移预后的关系。[结果]Array CGI1结果显示,在结直肠癌中存在7p、8q、13q、19p、20q的增益和4p、4q、8p、17p、18q、21q的缺失。其中13q12.2-q12.3.13q14.11和13q31.3发生高水平扩增；3q26.1、11qll、18q21.2和22q13.2存在纯合性缺失。通过比较基因组改变的频率分布图,我们发现7p、8q和18q在两组间存在最显著频率差异。IHC结果提示：在继发肝转移的结直肠癌中Ki67、MCM7和DNAJB6的阳性表达率分别为46.3%、74.1%和66.7%,均与肝转移相关(Ki67:x2=7.424, P=0.006; MCM7:x2= 24.371, P=0.001; DNAJB6:x2= 4.673, P=0.031)。[结论]结直肠癌继发肝转移基因拷贝数改变频率高、位点多,Ki67、MCM7和DNAJB6可能作为结直肠癌肝转移的分子标志。