近年来，随着高新技术企业对经济增长贡献比例的逐年加大，高新技术企业的重要性己经被人们广泛认可。但是，由于高新技术企业内部存在着具有不确定性的风险投资项目，如何评价高新技术企业价值就成为衡量高新技术企业实力的一项重要参考指标。本文阐述了高新技术企业自身的特征，介绍了现金流量法、相对价值法、经济增加值法和实物期权法这四种企业价值评估的主流方法，分析了这四种评估方法对评价高新技术企业价值的适用性。文章结合高新技术企业自身的特征，得出运用实物期权法和现金流量法对高新技术企业进行价值评估的优势，其中重点阐述了实物期权法对高新技术企业潜在获利能力评估的的优势。由此，提出了高新技术企业价值评估的模型，即高新技术企业是由稳定获利能力的价值和潜在获利能力的期权价值组成。在分析潜在获利能力价值时，本文运用了布莱克-斯科尔斯定价模型和二叉树定价模型，其中重点分析了以二叉树定价模型来计算高新技术企业的潜在获利能力的价值的优势，并且对二叉树定价模型进行了改进，对改进后的模型中的各要素也进行了说明。最后，以上市公司科达机电股份有限公司为分析案例，对构建的高新技术企业的价值模型进行验证，证明该评估方法的有效性。论文的最后指出了研究的不足与进一步研究的方向。