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生物强化除磷系统中，“Candidatus Accumulibacter phosphatis”是聚磷菌主要的功能细菌，研究者通过标记基因16 SrRNA以及ppk1建立了“CandidatusAccumulibacter phosphatis”的系统发育树，确定了聚磷茵具体的进化分支。通过将生物强化除磷系统性能与其详细的菌群进化分支相结合，更加深入了解聚磷菌在生物强化除磷系统中的作用。特别针对于不同电子受体环境下的聚磷菌来说，通过以上的研究方式能够了解不同聚磷菌的进化分支所适应的环境因素，以及从微观的角度探讨不同工艺中聚磷菌的进化分支所起的不同作用。 本研究构建了具有不同进化分支ppk1基因的质粒，建立了“CandidatusAccumulibacter phosphatis”五类进化分支以及细菌总群落的荧光定量PCR标准曲线。采用自动控制为基础的序批式反应器富集高浓度聚磷菌，经荧光原位杂交鉴定以及荧光定量PCR鉴定，所富集的“Candidatus Accumulibacter phosphatis”的数量占总细菌数的比例分别为90％以及87％，两者结论基本相近，其进化分支主要为CladeⅡA，其数量占聚磷菌全菌数量的91％，并存在少量的CladeⅡC以及CladeⅠ，该系统稳定运行期间富集系统除磷性能良好。 采用多组批次试验，考察硝酸盐以及pH、温度与亚硝酸盐浓度相耦合下对聚磷菌的代谢性能的影响以及聚磷菌在不同条件下受到亚硝酸盐的抑制情况，并分析了亚硝酸盐对聚磷菌的抑制机理以及反硝化聚磷菌富集的最适环境因素。经批次试验证明，本试验的CladeⅡA能够利用亚硝酸盐作为电子受体并不能利用硝酸盐作为电子受体，亚硝酸盐作为电子受体时反应速率低于氧气，但消耗较少的内碳源，且不同电子受体下环境因素对聚磷菌的影响也不同。 在71天反硝化聚磷菌富集过程中，稳定期反硝化除磷系统运行基本保持稳定，但是仍存在着崩溃的可能。通过FISH以及定量PCR的鉴定发现，本试验所富集的反硝化聚磷菌主要的“Candidatus Accumulibacter phosphatis”进化分支仍然为CladeⅡA，数量占聚磷菌全菌数的92％，基于16S rRNA的定量PCR同FISH定量结果一致，CladeⅠ被完全淘汰出反应器，而CladeⅡC含量有所上升。