5S rRNA的自然反义RNA的研究

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非编码RNA(ncRNA)是一类不翻译产生蛋白质的RNA分子。可由专门编码非编码RNA的基因转录而来,也可由部分内含子及基因间序列转录生成,或者由部分编码蛋白质的基因位点反向转录生成,广泛存在于生物体细胞中。ncRNA通常可按它在细胞内分布情况及其长度来分类,具备无开放阅读框、二级结构保守、时空表达有特异性三个共同特征。ncRNA的调控方式主要有碱基互补、模拟其他核酸结构、空间阻遏、催化、表观遗传修饰等,通过这些方法ncRNA对调节生命活动的基因进行多水平上的调控,包括影响基因转录及染色体结构、参与RNA成熟过程的加工修饰、控制RNA的翻译及其稳定性、调控蛋白水平、促进生物体进化等。  自然反义RNA(NAT)是与靶RNA序列互补的一类RNA分子,也属于ncRNA的一种。可分为顺式NAT和反式NAT两类。在真核生物中,参与基因组印记、RNAi、翻译、RNA编辑及X染色体失活等多种调控,对维持生物的正常生理功能起到了重要作用,是目前分子生物学研究的一大热点。  本文基于以上背景和前期预实验,对人类细胞中5SrRNANAT分子的存在进行了预测,并设计了一系列实验验证了5SrRNA的NAT分子在HeLa及PC-3细胞中的存在。  为了更进一步了解5SrRNA的NAT相关信息,在此前实验的基础上,我们又利用3’RACE的方法测定了5SrRNANAT分子的全长。虽然获得了更长的NAT分子片段,但无法确定是否是NAT的全长。因此5SrRNANAT分子的全长以及它后面所隐藏的分子机制仍需要进一步去发现。
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