侦查阶段排除非法证据是2012年修订的《刑事诉讼法》第54条规定的内容之一。在2012年及随后的两年里,与侦查阶段排除非法证据相关的司法解释和规则也相继出台。这些举措都在说明侦查阶段排除非法证据已从立法层面走向实施环节。当前及今后的一段时间内,侦查阶段排除非法证据面临的最大问题是实施机制的完善。从逻辑上讲,侦查阶段排除非法证据包括检察机关自侦案件侦查阶段的非法证据排除和公安机关一般刑事案件侦查阶段的非法证据排除。学界学者主要研究后者,本文讨论的侦查阶段排除非法证据问题亦是后者。侦查阶段排除非法证据的难点在于侦查阶段排除非法证据的机制完善,而侦查阶段排除非法证据排除机制完善又必须基于理论基础和司法实践。本文从侦查阶段排除非法证据存在的问题着手进行分析,以相关理论为解决问题的逻辑支撑和法理基础,进而提出了解决侦查阶段排除非法证据相关问题的建议。本文共计三个章目,约3万余字。第一章主要是侦查阶段排除非法证据制度的正当性,先是指出学界对于侦查阶段排除非法证据制度正当性的质疑,再从学理和我国国情两个方面对其进行回应,从而论证其正当性。第二章主要是侦查阶段排除非法证据制度及实施的问题及原因分析。问题包括:侦查阶段排除非法证据的可操作性不强。导致问题的原因有:客观义务理念的缺失、执行人员素质的良莠不齐,规定过于笼统,以及制度本身的超前性。第三章主要是侦查阶段排除非法证据存在问题的解决建议,包括完善侦查阶段排除非法证据机制,寻求提升侦查阶段排除非法证据人员素质的途径,细化侦查阶段排除非法证据的期间,提出排除后证据的处理建议。