高新技术产业在我国经济及社会发展中占有十分重要的地位，高新技术企业作为高新技术产业的细胞，其生存和发展直接关系着我国经济社会发展的全局乃至于国家安全。但我国高新技术企业的成本管理相对落后，严重影响着企业的生存及发展。战略成本管理是成本管理发展的新阶段，它将成本管理与企业战略融合，是符合高新技术企业特点的成本管理理念与方法。然而，我国高新技术企业对战略成本管理理论及方法的应用仍存在着很多问题急需解决。本文力求从实践出发，通过问卷调查及案例调研的方式从企业获得关于战略成本管理应用状况的第一手资料，进一步结合战略成本管理理论对其进行深入的分析，总结出了我国高新技术企业战略成本管理应用中存在的问题。本文将我国高新技术企业战略成本管理应用中存在的问题归纳为两类，一是基础条件薄弱，具体表现为不公平的竞争环境，能够掌握并运用战略成本管理理论的人才非常少，企业组织结构及信息系统建设不合理、企业员工成本意识淡薄等；二是对传统成本管理方法及思想的路径依赖，使得一些不合理、不适用的成本管理方法及思想仍然存在。在对我国高新技术企业战略成本管理应用中存在的问题的深入分析的基础上，本文有针对性的提出若干改进建议，并进一步结合战略成本管理理论体系尝试性的构建了我国高新技术企业战略成本管理的一般性应用系统框架，以期能将理论与实践相结合，有效提升我国高新技术企业战略成本管理的水平，促进我国高新技术企业更快、更好的发展。