我国高等教育综合改革的总目标是推进大学治理体系现代化,包括大学外部治理与大学内部治理的现代化,其内涵是顺应时代要求,建立政府、社会和大学的新型关系,建立运行有效的制度体系,形成多元的共治格局。大学内部治理的交易成本对多元共治的大学内部治理体系的科学性,以及大学内部治理有效性都具有重要影响。交易成本是当前大学内部治理过程中的必然产物,交易成本合理化是大学内部治理变迁的关键目标,大学内部治理能力提升是管控交易成本的根本途径。本文以政治交易成本理论与有限理性理论为指导,综合运用文献研究法、问卷调查法等方法,按照定性研究范式,探讨大学内部治理变革路径问题。本文中关于大学内部治理交易成本,是指大学平衡其内部各种利益关系,促成交往各方彼此合作以保障治理有效性的所有交易活动的成本。研究中采用问卷调查的方式,选取我国东部和西部的3所大学,对其内部治理现状进行了调查,通过数据的整理与分析,提出我国大学内部治理交易成本产生的主要原因是:大学内部治理的信息不对称且信息公开不完善、决策边界不清且存在路径依赖、现代治理知识与能力缺失、师生参与治理的实际参与度不高等。根据大学内部治理交易成本的表现与产生原因,比较分析交易成本的一般特性,本文将大学内部治理交易成本类型划分为信息与协调成本、知识性成本、组织结构性成本。信息与协调成本是指大学平衡其内部各种组织与个体利益保障治理有效性而获取、传递信息以及协调各种关系过程中所耗费的成本。知识性成本是指大学平衡治理知识专有性限制与治理现代化需求之间的矛盾,为改善决策质量与治理能力所耗费的成本。组织结构性成本是指大学为增强治理的有效性对内部监督救济等组织机构缺失或功能不完善及其影响进行补救和完善所耗费的成本。交易成本不合理制约了大学内部治理的有效性,要有效管控交易成本的大学内部治理变革策略有:增强大学内部治理的透明度,以减少信息与协调成本;提高大学内部治理的参与度,以减少知识性成本;完善组织监督与救济等内部治理功能,以减少组织结构性成本。