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稀有鮈鲫（Gobiocypris rarus）是我国特有的一种小型鲤科鱼类，并已作为一种新型的模式实验鱼应用于鱼类遗传学、鱼病学、环境科学以及转基因观赏鱼等研究领域。卵黄蛋白原(vitellogenin，Vg)是卵生动物卵黄形成过程中大量存在于雌性动物血液中的富含糖、脂、磷的高分子量蛋白，是几乎所有卵生动物卵黄蛋白的前体。本实验根据NCBI网站上公布的稀有鮈鲫卵黄蛋白原cDNA序列设计引物，通过普通PCR技术获得6299bp序列；然后以获得的6299bp序列的5’端为模板，设计两对引物，通过基因组步移技术克隆得到1285bp的序列。经过Seqman拼接软件后得到7573bp序列，其中卵黄蛋白原基因全序列长6595bp，上游调控序列978bp。经开放性阅读框分析得到：稀有鮈鲫卵黄蛋白原基因含有26个外显子和25个内含子，编码1299个氨基酸序列，CDS长3900bp。将稀有鮈鲫卵黄蛋白原cDNA基因序列进BLAST(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)同源性分析，结果发现：所得的序列与斑马鱼、鲮、喀拉鲃、唐鱼、锦鲤卵黄蛋白原基因cDNA序列的相似性分别为69%、88%、87%、63%、70%；经预测得到的稀有鮈鲫卵黄蛋白原氨基酸序列，与斑马鱼、鲮、喀拉鲃、唐鱼、锦鲤卵黄蛋白原氨基酸序列进行比对，相似性分别为76%、85%、91%、82%、88%。通过开放性阅读框分析，还发现，与斑马鱼相比，稀有鮈鲫卵黄蛋白原中插入了一段序列，长度为21bp，位于第1外显子和第3外显子之间，可能导致7个氨基酸序列的插入；另外，稀有鮈鲫卵黄蛋白原第22个外显子（252bp）比斑马鱼卵黄蛋白原第21个外显子（312bp）少了一段60bp的序列。将稀有鮈鲫和斑马鱼卵黄蛋白原基因序列均去除内含子，分别得到4212bp（稀有鮈鲫）和4256bp（斑马鱼）的卵黄蛋白原基因编码区，两者比较后发现相似性为69%。经BLAST比对发现，稀有鮈鲫卵黄蛋白原上游调控序列中220bp-838bp区间与朝鲜鱊（Acheilognathus yamatsutae）卵黄蛋白原基因启动子序列2857bp-3144bp区间有80%相似性。根据稀有鮈鲫卵巢的发育情况，可以将稀有鮈鲫的卵巢分为六期。本实验以稀有鮈鲫卵巢发育三个不同时期,卵黄发生前期（第I期）、卵黄发生期（第II期）、卵巢成熟后期（第III期）为研究对象，取肝脏组织提取RNA，通过荧光定量PCR技术检测稀有鮈鲫卵黄蛋白原的mRNA在三个时期内的定量表达。结果发现，在肝脏中，随着卵巢的发育，在第II期中卵黄蛋白原m RNA的表达量最高，相对表达量达到25.202，而第I期和第III期较低，仅2.4和1.0。本研究结果为丰富鱼类繁殖发育生物学，进一步探索稀有鮈鲫这一具有重要研究价值的鱼类提供科学依据。