水稻（Oryza sativa）是世界上最主要的粮食作物之一,世界上一半人口以水稻为主食。水稻起源于热带和亚热带,对低温非常敏感,低温严重影响水稻的地理分布、生长发育及产量。此外,在水稻任意生长发育时期都可能遭受低温影响,因此,挖掘并利用全生育期耐冷基因是解决水稻耐冷性的一个重要途径,相关研究对于我国甚至世界水稻生产有着十分重要的意义。本研究以一份籼稻背景的高阈值低温敏感突变体lts（low temperature sensitive）为研究对象,通过F₂临时和BC₅F₂永久群体构建和籍助BSA重测序与图位克隆以及RNAseq转录组分析技术对控制高阈值低温敏感突变体的遗传位点进行了遗传定位,并对定位区间内的候选基因进行了表达验证。主要结果如下:1.以LJ20（龙粳20,低温抗性粳稻材料）和lts为亲本构建了LJ20/lts F₂定位群体,并利用BSA（Bulked Segregant Analysis）重测序技术对该群体中两个极端表型的DNA混池进行了测序分析。结果显示:在7号和12号染色体上分别存在1个突变区域,其中,7号染色体的定位区间与前期研究结果一致。另外,本次研究结果和之前的研究结果都证实该突变表型受隐性基因控制。2.以NB（Newbonnet,广亲和的低温抗性材料）和lts为亲本构建了NB/ltsBC₅F₂的永久定位群体,并利用分子标记对7号染色体的定位区间进行了精细定位,结果将位于7号染色体上的oslts^a定位至SNP13和C61之间的65kb区域,且在定位区间范围内发现有12个预测的基因,对NB和永久定位群体中的近等基因系NB^lts比较测序共发现预测的基因上分别有6处SNP差异,其中5个分别位于3个未知基因的内含子上,只有1个相对有意义的SNP的差异发生在预测的一个转座子基因LOC＿Os07g04480的5′-UTR上（G-A）,该基因没有被报道。因此,将其视作为候选基因,并正在对它的功能进行验证。3.通过RNA-seq（转录组测序）技术对lts和NB^lts近等基因系（H9301）以及NB对照在低温处理前后的转录本进行了测序及基因表达差异分析,在之前的oslts^a定位区间,发现LOC＿Os07g04930在5′-UTR上存在1处碱基的替换突变,引发了该基因在抗感材料花药组织中的表达量出现巨大差异,虽然在低温处理后该基因在抗感材料中的总体表达量是下调的,但抗感材料间的差异却是显著加大,由原来的24倍加大到1118倍,加大的原因主要是抗性材料的表达量下调的更多。q PCR验证结果显示该基因在抗感材料中的表达量差异和低温处理后的下调趋势与RNA-seq数据基本一致。因此,确定将该基因和前面的LOC＿Os07g04480一起处作为oslts^a的目标候选基因,后期拟对这2个基因进行功能验证。