广西沼泽型水牛细胞因子基因的克隆与序列分析——(IL-2、IL-4、IL-5、IL-10、IL-12(p35、p40)、IL-18和TNF-α)

来源 :广西大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hujun_xiao
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
本实验将本地沼泽型成年水牛外周血单核细胞(Peripheral bloodmononuclear cells,PBMC)在刀豆素A(Concanavalin A,ConA)的刺激下体外培养,提取培养的单核细胞总RNA,应用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)技术扩增水牛白细胞介素-2(interleukin-2,IL-2)、白细胞介素-4(interleukin-4,IL-4)、白细胞介素-5(interleukin-5,IL-5)、白细胞介素-10(interleukin-10.IL-10)、白细胞介素-12(interleukin-12,IL-12)、白细胞介素-18(interleukin-18,IL-18)和肿瘤坏死因子-α(Tumor necrosis factor alpha,TNF-α),并克隆到pMD18-T载体上,然后进行测序。 序列分析显示,克隆的IL-2 cDNA长724bp.包括一个全长为468bp的完整编码区(ORF).共编码155个氨基酸,分子量为17.5KDa。在核苷酸水平上与印度水牛、牛、绵羊、山羊、猪、狗、人和鼠的IL-2基因同源性为99.6%、98.5%、98.3%、97.4%、85.6%、78.4%、80.3%、65.2%;推导的氨基酸序列同源性为98.7%、96.8%、96.2%、94.2%、72.9%、61.5%、64.9%、48.7%。 克隆的IL-4 cDNA长469bp,包括一个全长为408bp的完整编码区(ORF),共编码135个氨基酸,分子量为15.0KDa。在核苷酸水平上与印度河流型水牛、牛、绵羊、猪、马、鼠和人的IL-4 cDNA同源性分别为98.8%、99.3%、94.1%、84.8%、80.6%、62.7%和75.2%;推导的氨基酸的同源性分别为96.3%、98.5%、90.4%、78.4%59.6%、39.0%和64.7%。 克隆的IL-5 cDNA序列,长430bp,ORF为405bp,共编码134个氨基酸,分子量为15.3KDa。经与GenBank中牛、绵羊、猪和马的IL-5 cDNA序列比较可知,所克隆的基因与它们的同源性分别为99.0%、96.5%、89.6%和89.1%。氨基酸的同源性分别为97.8%、96.2%、85.9%和86.7%。 克隆的水牛IL-10的完整编码区cDNA序列,经分析其开放阅读框架(ORF)长为536bp,编码178个氨基酸,分子量为22.4KDa。与GenBank中印度河流型水牛、牛、羊、猪、马、人和鼠的IL-10 cDNA序列比较可知,所克隆的IL-10基因与它们的同源性为99.6%、97.2%、93.6%、83.9%、89.0%、85.1%和75.8%。氨基酸的同源性为100%、93.3%、89.3%、79.5%、88.2%、80.9%和74.2%。 克隆的水牛IL-12 p35基因序列全长694bp,含一个全长为666bp的完整开放阅读框(ORF),编码222个氨基酸,推测其分子质量为24.86kDa。与GenBank登录的印度河流型水牛p35的核苷酸同源性为99.7%,氨基酸同源性为98.6%,与牛、羊、猪、马、人和鼠的核苷酸同源性为98.5%、97.7%、77.6%、85.3%、85.3%和70.0%,氨基酸同源性为97.3%、95.5%、68.5%、79.7%、81.1%和55.9%。克隆的水牛IL-12 p40基因序列全长1013bp,含一个全长为984bp的完整开放阅读框(ORF),编码328个氨基酸,推测其分子质量为37.03 kDa。与GenBank登录的印度河流型水牛p40的核苷酸同源性为99.5%,氨基酸同源性为98.8%,与牛、羊、猪、人和鼠的核苷酸同源性为98.6%、97.4%、81.1%、87.7%和74.9%,氨基酸同源性为97.6%、96.0%、75.6%、83.8%和67.7%。 克隆的水牛IL-18基因序列全长602bp,含一个全长为582bp的完整开放阅读框(ORF),编码193个氨基酸,推测其分子质量为22.18kDa。与GenBank登录的印度河流型水牛IL-18的核苷酸同源性为99.1%,氨基酸同源性为99.0%,与牛、绵羊、山羊、猪、马、人和鼠的核苷酸同源性为99.3%、97.8%、97.1%、91.5%、91.6%、85.6%和67.7%,氨基酸同源性为98.5%、94.8%、94.3%、89.1%、、87.1%、77.8%和60.6%。 克隆的水牛TNF-α基因序列全长715bp,含一个全长为705bp的完整开放阅读框(ORF),编码234个氨基酸,推测其分子质量为25.56kDa。与GenBank登录的印度河流型水牛TNF-α的核苷酸同源性为99.7%,氨基酸同源性为98.7%,与牛、绵羊、山羊、猪、人的核苷酸同源性为98.6%、95.6%、96.2%、84.0%和73.0%,氨基酸同源性为97.9%、91.5%、91.9%、80.7%和70.6%。 这些结果表明本实验成功克隆出水牛的IL-2、IL-4、IL-5、IL-10、IL-12(p35、p40)、IL-18和TNF-α基因,为今后研究和利用水牛细胞因子,更全面、更深入地研究水牛免疫系统和有效的防制水牛疾病打下基础。
其他文献
信息技术指的是利用计算机、网络等设备与软件工具,对多媒体信息进行获取与加工、存储、传输与使用的技术.当前在小学数学教学中应用信息技术,具有很多的应用优势,但是也会出
建德县田畈煤矿在学习外地经验的基础上,就地利用丰富的煤矸石资源,采用碱调工艺,从煤矸石中提取出净化水质用的混凝剂—聚合氯化铝,其含铝量(Al_2O_3)为12%—14%,碱化度为6
思想品德是初中课程体系的重要组成部分,它融合了道德、心理健康、法律、国情等多方面内容,对促进学生全面发展具有重要意义.但随着时代的发展和课程改革的推进,思想品德的教
在素质教育蓬勃发展的当下,高中阶段对于学生而言是非常关键的,是学生性格和习惯养成的关键时期,也是他们人生观和价值观形成的重要阶段,因此高中生物教师在进行课堂教学时,
立足历史教学课堂,围绕课程标准,尊重学生的个性发展和整体的全面发展,运用多样化的教学方法和有效的教学手段,整合相关学科,挖掘历史学科的功能,促进学生学科核心素养的养成
随着当前时代的发展,人们越来越认识到小学教育对学生培养的基础作用,良好的小学教育为学生的发展提供最基本的素质能力,然而在小学阶段的教育当中,由于学生年龄小,天性自然,
当前新课标对初中语文教学提出了更高的要求,教师要提升语文教学的有效性,这就需要对以往的教学模式和方法进行改变,应用有效的教学方法,提升教学的效率和效果.主题式教学就
随着社会的不断发展和进步,英语阅读能力对于学生来说,是必须要加强的能力.不管是在现在的学习还是在以后的工作当中,学生都会面临着要阅读很多的英文书籍资料,报刊等.这就要
师生关系是学校中最基本,也是最主要的人际关系,它包含十分丰富的社会、伦理、教育和心理方面的内容。师生关系如何正确处理,关系到班级活动的顺利开展和学生身心的全面发展。长期以来师生关系问题一直是教育理论和实践关注的焦点,也是世界性教育教学改革的重要方面。师生关系作为众多社会关系中一种,和其它人际关系一样,其存在和发展始终是动态的,受社会生活多方面因素的影响和制约。在新的历史时期,师生关系发生了明显的变