ISO9000质理管理体系是国际公认的科学的管理体系,国外许多政府部门已建立和运行了基于ISO9000标准的体系,细化了政府行政管理,更好地履行了政府职能。我国自1999年以来,政府机关根据内、外部的需要建立自身的质量管理体系,树立高效、低耗、廉洁、提供一流服务的政府新形象,这已成为政府机关管理现代化的一种新趋势。检验检疫部门作为引导、鼓励企业实施质量管理体系的主要部门,自身也率先导入了ISO9000质理管理体系,已形成明显的行业优势。但毋庸讳言的是检验检疫机构应用这套标准由于理解偏差、应用僵化、手段缺乏等诸多原因,大大降低了ISO9000质理管理体系应用的效果。本文首先阐述了ISO9000标准的概念及其核心管理思想,以及其与检验检疫职能要求相适应的共性特征,接着以检验检疫机构为特定对象,探讨了ISO9000质量管理体系在检验检疫机构的特殊理论内涵,然后又就质理管理体系运行中存在的问题进行了分析,最后通过运用质量管理的理论和工具,提出了实现质量管理体系有效性的方法和途径。