神经母细胞瘤是最常见的儿童恶性肿瘤之一,也是最难治疗的肿瘤之一,它是一种胚源性肿瘤,起源于神经嵴。部分神经母细胞瘤可自行退化,使用诱导剂也可以促进神经母细胞瘤分化。神经母细胞瘤细胞系(SH-SY5Y)是神经发育的良好模型,通过应用转录组学分析技术研究这种模型,可以深入了解神经元分化过程的分子机制,并为肿瘤的临床治疗提供分子靶标。维甲酸(RA)是一种强诱导分化剂,具有调控细胞分化和增殖能力,它可以诱导神经母细胞瘤分化,使其发生逆转,这种作用是由于它可以改变细胞的基因表达。应用寡核苷酸芯片研究维甲酸诱导神经母细胞瘤分化过程中基因表达的整体变化,对于全面揭示该过程的分子事件及肿瘤的生物学行为具有重要意义。为了能够在基因组水平上认识SH-SY5Y在RA诱导分化过程中的基因表达调控,我们从人胎脑及不同类型神经系统肿瘤组织中分离得到与神经功能相关的基因209条,通过公共数据库Genebank、EMBL等查寻其mRNA序列信息,设计基因特异寡核苷酸探针,制成神经功能相关的寡核苷酸芯片。用RA诱导SH-SY5Y细胞8天分化成神经元,收集实验组和对照组(未加RA )1—8天的SH-SY5Y细胞的总RNA,应用制备的寡核苷酸芯片筛选诱导分化过程中基因的表达差异,结果发现了13个表达上调的基因,但未发现下调基因。挑选了五个基因Mab2ll2、protein4.1N、SCG10、PS2、GAS6进行RT-PCR验证,与芯片结果基本一致。寡核苷酸芯片分析和RT-PCR之间具有很好的相关性,这表明我们所构建的寡核苷酸芯片能有效地用于基因表达谱分析。此外,我们利用寡核苷酸芯片筛选出差异表达的基因将会有助于人们对SH-SY5Y诱导分化成神经元过程中的分子机制做进一步的了解。