自我国市场经济开始进行资本运作,企业之间的并购对其发展起到了举足轻重的作用。企业为了扩大自己的规模,获取更多的资源,通过并购达到自己的目的,这里面也不乏医药企业。虽然并购是企业扩张的常见手段,但并不是所有并购都是成功的,根据相关数据分析,在中国有50%以上的并购行为最后会因为各种原因不能成功实施。企业的并购行为本身就是一个不可逆转的行为,同时由于并购会涉及大量的资金运作,这里面存在很大的财务风险。通过了解和分析并购中所存在的财务风险,针对这些财务风险有计划性地去应对,有利于提升企业风险管理的有效性,同时也降低了失败并购案例的发生,为企业并购后的经营发展提供强有力的支撑。医保控价、两票制等新医改政策的实施,给医药企业的转型及发展带来了莫大的挑战,大型医药企业也通过并购的方式稳固市场地位。本文选取目前的朝阳产业医药行业为研究背景,结合理论与案例共用的方式对医药企业并购进行全面研究。首先,描述我国医药企业并购的现状,对国内外学者的企业并购财务风险已有的相关研究进行归纳总结,同时阐述企业并购的类型以及并购财务风险相关理论,为之后的案例分析提供扎实的理论支持。然后选取华润三九并购众益制药这一案例进行深入研究,追踪并购全过程,从企业自身经营及行业环境分析并购动因,同时分析并购过程中存在的财务风险及风险来源。本文研究结果发现并购前华润三九对众益制药的估值较为合理,估值风险较小;并购中因融资及支付方式单一造成企业资金结构不稳定而带来融资支付风险;并购后整合速度缓慢,这主要是双方财务组织结构不一致,人员配置等因素存在。文章结合案例就并购每个阶段的主要财务风险提出了相应的应对措施。医药行业的并购案例每年都在增加,本文希望通过对华润三九并购众益制药的案例分析,能够对行业中的并购提供相关的理论指导及建议,降低并购财务风险发生的可能性,减少并购案例的失败率,从而促进医药行业的整体良性发展。