深圳地区哨点监测医院五岁以下儿童病毒性腹泻的分子流行病学研究

来源 :南方医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sii923
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究目的比较分析轮状病毒(Rotavirus,RV)、诺如病毒(Norovirus,NoV)、人副肠孤病毒(ParechovirusA,PeV-A)、星状病毒(Astrovirus,AstV)和肠道腺病毒(Adenovirus,AdV)在深圳地区哨点检测医院儿科门诊和住院病毒性腹泻患儿中的流行病学特征,以期进一步明确深圳地区病毒性腹泻患儿病原谱构成,旨在为病毒性腹泻的科学防治提供依据。研究方法1.收集2017年1月至2018年12月深圳地区哨点监测医院五岁以下1003例门诊和497例住院腹泻患儿病例信息和粪便样本。2.粪便样本经致病菌检测结果阴性后,进行病毒检测和基因分型:提取粪便样本总核酸,设计探针和引物,采用荧光PCR检测5种腹泻病毒;再采用PCR和RT-PCR扩增5种病毒基因分型片段,并进行双向测序,测序结果经BioEdit、MEGA软件剪切比对后,与NCBI中的参考序列比对分型。3.统计分析:数据录入使用EpiData 3.1软件,数据统计分析使用SPSS 22.0软件。结果1.总体检出情况:1500例五岁以下病毒性腹泻患儿中,检测出至少一种腹泻病毒共715例,总检出率为47.67%。5种病毒检出率依次如下:RV为21.27%(319/1500)、NoV 为 16.27%(244/1500)、PeV-A 为 10.20%(153/1500)、AstV为3.00%(45/1500)、AdV为2.53%(38/1500),检出率差异有统计学意义(χ2=312.833,P<0.001)。1003例门诊病毒性腹泻患儿中,检测出至少一种腹泻病毒共443例,总检出率为44.17%。5种病毒检出率依次如下:NoV为16.55%(166/1003)、RV为15.55%(156/1003)、PeV-A 为 11.17%(112/1003)、AstV 为 3.39%(34/1003)、AdV为2.83%(31/1003),检出率差异有统计学意义(χ2=423.704,P<0.001)。497例住院病毒性腹泻患儿中,检测出至少一种腹泻病毒共272例,总检出率为54.73%。5种病毒检出率依次如下:RV为32.80%(163/497)、NoV为15.69%(78/497)、PeV-A为 8.25%(41/497)、AstV 为 2.21%(11/497)、AdV 为 1.41%(7/497),检出率差异有统计学意义(χ2=186.412,P<0.001)。住院病例五种腹泻病毒总检出率明显高于门诊病例五种腹泻病毒总检出率(χ2=14.858,P<0.001),且住院病例RV检出率明显高于门诊病例RV检出率(χ2=59.014,P<0.001)。2.不同性别和年龄5种病毒检出情况:五岁以下病毒性腹泻患儿中,不同性别5种病毒检出率差异均无统计学意义。而不同月龄组RV、NoV、AstV、PeV-A检出率差异有统计学意义(χ2=171.614,P<0.001;χ2=46.570,P<0.001;χ2=17.057,P=0.004;χ2=61.783,P<0.001)。RV感染年龄集中13~60月龄;NoV感染年龄集中6月龄以上;AstV感染年龄集中在19~60月龄;PeV-A感染年龄集中在0~12月龄。3.不同月份5种病毒检出情况:五岁以下病毒性腹泻患儿中,不同月份间RV、NoV、PeV-A 检出率差异有统计学意义(χ2=655.837,P<0.001;χ2=113.29,P<0.001;χ2=120.718,P<0.001),RV检出高峰集中在12月~3月份间;NoV检出高峰集中在8月~11月间;PeV-A检出高峰集中在7月~9月份间。AdV和AstV未发现明显时间分布规律。4.5种病毒基因型分型结果:五岁以下病毒性腹泻患儿中,RV的G基因型中以G9为主,其次为G1、G2、G3、G4。P基因型中以P[8]为主,其次为P[4]。G/P 组合基因型中以 G9P[8]为主,其次为 G1P[8]、G2P[4]、G3P[8]、G9P[4]、G1P[4]、G2P[8]和 G4P[8]。住院病例中 G1P[4](1.21%,6/497)、G2P[8](1.01%,5/497)、G9P[4](1.41%,7/497)和 G9P[8](16.50%,82/497)的检出率分别高于门诊病例中 G1P[4](0.10%,1/1003)、G2P[8](0/1003)、G9P[4](0.10%,1/1003)和G9P[8](9.67%,97/1003)的检出率(χ2=88.119,P<0.001)。NoV 以 GⅡ.Pe-GⅡ.4 为主,其次为 GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.P1 6-GⅡ.2、GⅡ.P16-GⅡ.4、GⅡ.P7-GⅡ.6、GⅡ.17、GⅡ.3、GⅡ.Pe-GⅡ.6、GⅠ.P2-GⅠ.2、GⅠ.Pd-GⅠ.3和GⅠ.P4-GⅠ.5。门诊病例中GⅡ.P16-GⅡ.2(1.89%,19/1003)的检出率明显高于住院病例中 GⅡ.P16-GⅡ.2(0.40%,2/497)的检出率(χ2=21.949,P=0.038)。AdV只检测出AdV41一种基因型。AstV以AstV-1为主,其次为AstV-4、AstV-5 和 AstV-3。PeV-A 以 PeV-A 1B 为主,其次为 PeV-A4、PeV-A 14、PeV-A 1A、PeV-A 3、PeV-A 5 和 PeV-A 6。门诊病例中 PeV-A 1A(0.30%,3/1003)检出率明显低于住院病例中PeV-A 1A(1.41%,7/497)检出率,门诊病例中PeV-A 1B(7.88%,79/1003)检出率明显高于住院病例中PeV-A 1B(4.63%,23/497)检出率(χ2=19.537,P=0.007)。5.混合感染情况:五岁以下病毒性腹泻患儿中以单一病毒感染为主(42.07%,631/1500);2重感染检出率为5.33%(80/1500);3重感染检出率为0.26%(4/1500)。以NoV+PeV-A混合感染最常见。结论1.RV是引起五岁以下儿童住院腹泻最主要的病原体。2.不同年龄腹泻患儿病毒感染谱不一样:RV主要感染1岁以上腹泻患儿,NoV主要感染6月龄以上腹泻患儿;Pe V-A主要感染1岁以下腹泻患儿。3.不同病原体在不同季节存在流行差异:RV以12月~3月份为发病高峰期;NoV以8月~11月份为发病高峰期;PeV-A以7月~9月份为发病高峰期。4.五岁以下病毒性腹泻儿童中,RV以G9、P[8]、G9P[8]为主;NoV以GⅡ.Pe-GⅡ.4 为主;AdV 以 AdV 41 为主;AstV 以 AstV-1 为主;PeV-A 以 PeV-A 1B 为主,其中 G1P[4]、G2P[8]、G9P[4]、G9P[8]、PeV-A 1A 与住院腹泻患儿相关,GⅡ.P16-GⅡ.2、PeV-A 1B与门诊腹泻患儿相关。
其他文献
遵义市播州区新民镇坚守发展和生态两条底线,以弯道取直、后发赶超的拼劲,凝心聚力、攻坚克难的韧劲,推进经济快速增长,拓宽群众致富渠道。狠抓脱贫攻坚,全面推进小康进程。
目的了解针吸细胞学检查对乳癌诊断的临床意义.方法对196例乳腺肿瘤病人进行针吸细胞学检查.结果 196 例病人针吸细胞学检查找到癌细胞96例,发现增生活跃细胞5例,细胞形态正
目的通过分析糖尿病合并感染的临床特征,进一步预防和控制糖尿病的感染.方法对80例糖尿病合并感染者进行回顾性分析.结果 193例糖尿病患者,并发感染80例,感染率41.5%.其中老
党的十九大报告提出实施健康中国战略。加快推动优质医疗资源下沉,在贵州具有重要意义,成为医疗卫生事业改革发展十分紧迫而重大的任务。
笔者介绍了西班牙语计算机术语的六个特点:不稳定性和瞬时性、缺乏统一性、快而广的传播、普通词汇和专业词汇的融会、英语占主导地位及大量新术语的产生。文章旨在为该类术
目前,功能性纳米材料的应用是科学研究重要方向。在非贵金属Cu纳米催化剂的基础上引入其它金属元素,设计构筑一系列具有特定结构、形貌的二元铜基纳米金属催化剂,可以达到改变催化剂活性组分的电子性能和几何结构、改善铜基纳米催化剂的催化性能的目的。本论文研究铜基纳米催化剂的组成、形貌、结构与催化硝基芳烃加氢制备氨基芳烃催化性能的构效关系和作用机理,研究成果总结如下。在纳米Cu基催化剂中引入贵金属Pt,采用湿
如何将传统工艺振兴与精准扶贫结合,如何让大山里的手工艺走向世界?册亨县以辖区保存完整的民族纺织、刺绣、染印、服饰制作等传统技艺为依托,大力实施"锦绣计划",着力培养知识