猪Casp8ap2基因SNP检测、产仔数性状关联及表达调控分析

来源 :华中农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fly_songs
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
猪是人类食用肉类的主要来源之一,提高猪的繁殖力是增加养猪业生产效益的重要途径,许多科学家致力于猪产仔数方面的研究。最常用方法是分子标记辅助选择,因为猪产仔数性状是限性遗传,且遗传力较为低下。我们的前期研究筛选出了包含Casp8ap2基因在内的一些中国太湖猪和大白猪排卵前卵泡差异表达基因。Caspase家族基因可能通过凋亡机制阻止妊娠期、胚胎发生、幼体期及精子形成等生理过程的分化异常。因此,我们以Casp8ap2基因为猪产仔数候选基因进行研究,取得了如下结果:  1.SNP检测及产仔数性状关联分析  (1)在猪Casp8ap2基因启动子区发现一个SNP位点,即g.-752A>G,建立该多态位点的PCR-StyI-RFLP检测技术。在通城猪和梅山猪中,A等位基因是优势基因;在农科院大白猪、中国瘦肉猪新品系DIV猪等8个猪种中,G等位基因是优势基因。在大白猪和第DIV系猪中进行g.-752A>G位点与产仔数性状关联分析,结果显示大白猪GG基因型的总胎次产活仔数显著高于AA型(P<0.05),但加性效应值并未达到显著水平。  (2)在猪Casp8ap2基因第二内含子区发现一个SNP位点,即g.105624-253T>C,建立该多态位点的PCR-NdeI-RFLP检测技术。在梅山猪和通城猪中,C等位基因是优势基因;在农科院大白猪、中国瘦肉猪新品系DIV猪等8个猪种中,T等位基因是优势基因。在大白猪和第DIV系猪中进行g.105624-253T>C位点与产仔数性状关联分析,结果显示所有数据差异均未达到显著水平。  (3)在猪Casp8ap2基因第二内含子区发现另一个SNP位点,即g.105624-91A>G,建立该多态位点的PCR-FokI-RFLP检测技术。在梅山猪和通城猪中,G等位基因是优势基因;在大白猪、中国瘦肉猪新品系DIV猪等8个猪种中,A等位基因是优势基因。在农科院大白猪和第DIV系猪中进行g.105624-91A>G位点与产仔数性状关联分析,结果显示所有数据差异均未达到显著水平。  2. Casp8ap2基因核心启动子区确定  利用生物信息学软件BDGP预测猪Casp8ap2基因启动子区1520bp序列得到4个潜在核心启动子区,并成功构建5个缺失片段(Del-1、Del-2、 Del-3、 Del-4、Del-5)的重组PGL-3报告载体。采用脂质体转染法,将这五个缺失片段表达载体与PGL3-Basic阴性对照组、PGL3-Control阳性对照组转染到CHO细胞系和Hela细胞系中,鉴定得出:核心启动子位于第四个预测的核心启动子区内(-310bp~-91bp);另外,-1495bp~-1312bp和-1312bp~-725bp两个区域内可能存在负调控位点,-725bp~-310bp区域可能存在组织特异性调控位点,-310bp~-91bp区域可能存在正调控位点。  3.猪Casp8ap2核心启动子区转录因子研究  利用生物信息学软件 TFSEARCH分析猪Casp8ap2核心启动子区(-310bp~-91bp),预测出与猪繁殖性状有关的三个潜在转录因子Sox-5、Kr、C/EBPα结合位点。构建转录因子结合位点突变型pGL3重组载体并转染验证,C/EBPα还同时做超表达分析,双荧光素酶报告分析显示可能确实有相应转录因子通过转录因子Sox-5、Kr、C/EBPα结合位点作用于Casp8ap2基因。
其他文献
作为智能交通系统中车辆识别的核心部分,车型识别已成为新的热门研究方向.本文通过对当前车型识别存在的问题进行分析,以及对当前车型识别技术深入研究,本文选择卷积神经网络
本文通过研究提出了通信机房空调冷凝水自动回收再利用的新方法,经实际使用证明具有较好的效果,在满足通信机房温度和湿度要求的同时,达到了降本增效、节能减排的功效.
大豆蛋白在热聚集后溶解性下降,乳化活性降低,限制大豆蛋白在食品中的应用.因此研究者尝试运用不同技术手段调控大豆分离蛋白的聚集机制.结合实际,针对超声处理对大豆分离蛋
若要有效将智能化电子控制系统落实入大型起重机设备内,一方面管理人员需做好大型起重机设备的型号、规格、参数、操作特性的调查,分析是否适用,以避免影响控制系统的可行性;
该试验研究了大熊猫皮肤组织细胞的分离,进行了大熊猫皮肤成纤维细胞体外培养体系的设计,初步建立了大熊猫皮肤成纤维细胞系,并对培养的细胞进行了种属鉴定和冷冻保存.研究认
自动剪板设备摇摆摇摆剪线中的吸盘堆垛机的粗略设计.
随着我国高等教育事业的不断发展,为适应新时期的高校党务形势的变化,对高校的党务工作人员也提出了更高的要求.在研究新时期的高校党务工作现状的基础上,分析了高校党务工作
氟苯尼考是一种人工合成的高效广谱动物专用抗生素,常用于防治动物的各种细菌性疾病。但由于不规范使用和滥用,它在动物食品中会产生残留,并因此带来各种问题。为了保障食品