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[目的]研究肺炎衣原体(Cpn)感染与肺癌发病风险的关联;检测Cpn阳性/阴性肺癌组织及癌旁组织全基因组DNA甲基化水平,筛选出肺癌组织中Cpn感染相关差异甲基化基因,探讨Cpn感染、DNA甲基化与肺癌间的关系。[方法]1、本研究采用以医院为基础的病例-对照研究设计,收集2012年12月至2015年7月福建医科大学附属第一医院、协和医院和南京军区福州总医院的胸外科,经病理或细胞学确诊为原发性肺癌新发病例298例;按性别、年龄(±2岁)与病例组进行频数匹配的健康对照362例。所有研究对象首次入院时,采用统一编制的调查表,面访收集研究对象的一般情况、病例情况、居住环境、吸烟史、饮酒史、饮茶史等资料。然后由该医院护士采集晨起空腹外周静脉血5 ml,离心分离血清,采用微量间接免疫荧光(MIF)法检测血清中Cpn抗体IgG,IgA。2、按年龄、性别、病理类型、肿瘤分期、疾病史、吸烟、饮酒等因素进行1:1匹配的方法,在病例组中筛选出6个Cpn阳性肺癌患者和6个Cpn阴性肺癌患者。收集术中切除的肺癌组织和癌旁组织标本,提取基因组DNA,进行重亚硫酸盐转化,应用Illumina HD 450K Infinium Methylation BeadChip分析Cpn阳性/阴性肺癌组织及癌旁组织DNA的甲基化水平,找出与Cpn感染相关差异甲基化基因,对差异甲基化基因进行非监督聚类分析和生物功能富集分析。[结果]1、对照组Cpn-IgG阳性率为51.4%,Cpn-IgA阳性率为22.4%;病例组Cpn-IgG阳性率为68.8%,Cpn-IgA阳性率为41.3%。调整人口学及相关因素后,Cpn-IgG阳性者发生肺癌的风险是Cpn-IgG阴性者的2.13倍(95%CI:1.47-3.09);Cpn-IgA阳性者发生肺癌的风险是Cpn-IgA阴性者的2.57倍(95%CI:1.72-3.82),提示Cpn感染与肺癌的发病风险密切相关。2、按性别、年龄、吸烟进行分层分析,结果发现除了女性人群Cpn感染与肺癌的关联无统计学意义(Cpn-IgG:OR=1.54,95%CI:0.81-2.96;Cpn-IgA:OR=1.87,95%CI:0.91-3.84),而在男性、吸烟、非吸烟、年龄<60岁、年龄≤60岁人群中,Cpn感染与肺癌的关联均有统计学意义,其OR值及95%CI分别为,Cpn-IgG:2.70(1.69-4.30)、2.42(1.42-4.13)、1.83(1.08-3.11)、2.09(1.29-3.40)、2.41(1.31-4.43);Cpn-IgGA:2.80(1.71-4.59)、3.49(1.91-6.40)、1.88(1.07-3.31)、2.41(1.38-4.21)、3.01(1.67-5.42)。3、分别对Cpn-IgG、IgA与吸烟、室内外环境(居住地污染、室内装修)对肺癌影响的联合作用分析,发现Cpn-IgG、IgA阳性分别与吸烟、室内外污染因素间存在联合作用。4、比较Cpn阳性肺癌患者的肺癌组织及相应癌旁组织的全基因组DNA甲基化模式,结果显示有2349个差异甲基化基因仅存在于Cpn阳性肺癌组织中而不存在相应的癌旁组织中,其中1525个基因发生异常高甲基化,824个基因发生异常低甲基化;比较Cpn阴性肺癌患者的肺癌组织及相应癌旁组织的全基因组DNA甲基化模式,结果显示有2622个差异甲基化基因仅存在于Cpn阴性肺癌组织中,不存在相应的癌旁组织中,其中1570个基因发生异常高甲基化,1052个基因发生异常低甲基化。5、综合比较分析发现肺癌组织中共有73个差异甲基化基因与Cpn感染有关。采用Gene ontology富集分析,发现这73个差异甲基化基因参与10条生物学通路,其中7条生物学通路涉及生物学过程,3条生物学通路涉及分子功能。[结论]1、肺炎衣原体感染不仅是肺癌独立的危险因子,而且可能与吸烟、室内外环境污染因素间存在协同致癌作用。2、Cpn感染可能通过改变某些基因的甲基化水平而参与肺癌的发生发展。