要实现从农业大国向农业强国的转变,积极推进农业产业化进程,就必须推进农业发展模式的转变,积极创新农业经济组织形式。农民专业合作社作为新兴的农业经济组织形式,把处于弱势行业的弱势群体组织起来,致力于解决小生产与大市场之间的矛盾。积极发展农民专业合作社是农业生产力发展的必然要求,是推进农业产业化进程、提高农业综合生产能力和促进农民增收的有效途径。新疆是棉花生产大省,如何创建适合新疆棉花生产的棉花专业合作社就成了新疆农业产业化进程中必须要解决的问题。自《农民专业合作社法》颁布以来,我国的农民专业合作社建设步入了法制轨道,相关扶持政策的相继出台更加促进了各个领域各种类型农民专业合作社的蓬勃发展。在农民专业合作社的发展中也出现了诸如合作紧密性不强、规范性发展不足和内部运行机制不健全等一系列问题。因此,如何从合作社运营模式的角度出发来理清合作社的发展思路以及解决合作社发展中出现的各类问题,已经成为了决定合作社发展成败的关键因素。本研究首先从合作社运营管理模式的相关要素进行分析,找到决定合作社发展的关键因素;接下来对国内外专业合作社的运营管理现状进行分析,对合作社发展的经验启示进行了总结;最后结合新疆棉花生产现状以及新疆既有棉花专业合作社发展中出现的问题,对新疆棉花专业合作社运营管理的成立机制、产权结构、利益分配机制和决策机制等方面进行深入的剖析,同时还探讨了政府在新疆棉花专业合作社发展中的作用,力求使这些探讨为新疆棉花专业合作社的建设提供现实的参考价值。