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知识产权是人们依法对科学、技术、文学艺术等领域的智力成果和商业识别性标记所享有的专有权利。知识产权制度对于高新技术企业的科技创新具有深远意义。当前，深入探讨我国高新技术企业科技创新中的知识产权制度问题，对于提高高新技术企业科技创新水平、提升国家的自主能力，既是一个不容忽视的理论问题，也是一个迫在眉睫的实际问题。 本文从法学、经济学、管理学等跨学科的角度切入，采用文献资料、比较研究、归纳演绎、统计分析等方法，以专利为中心，对知识产权制度在高新技术企业科技创新中的作用以及存在的问题进行了深入研究。并通过统计分析相对健全的发达国家高新技术企业科技创新的知识产权制度，对我国高新技术企业技术科技创新中的知识产权制度进行了整体性的分析和具有可操作性的构建。