党和政府历来高度重视“三农问题”，“三农问题”解决的出路在于县域农业科技进步，实现由传统农业向现代农业的转型。而县域农业科技进步的关键是通过农业新技术成果转化来培育和壮大农业特色产业。但是，由于我国农业的基础性、长期存在的弱质性以及小农户生产的分散性等，决定了县域农业特色产业创新必须采取政府主导和市场机制相结合的方式。以往关于农业科技成果转化研究，较多地关注了农业技术成果本身、技术成果交易和技术开发与推广使用主体等问题，缺乏系统的思考。因为，县域农业新技术成果转化的过程实质上是一项系统工程。 本文以科技部、财政部组织实施的“科技富民强县专项行动计划”（以下简称专项行动）试点工作为实践经验，采用系统工程的思路，以产业创新理论为指导，在进行实地调研、统计分析和案例研究的基础上，对现阶段我国县域农业特色产业创新问题进行了较为系统的研究，取得的主要创新性成果如下： 1. 界定了县域农业特色产业创新的内涵、特征和条件。根据对专项行动试点工作的总结分析，将它视为由政府主导的县域农业特色产业创新活动，是一项县域农业特色产业新技术成果转化的系统工程；并提出了县域农业特色产业创新的特征；依据2004年全国县（市）科技工作问卷调查数据和398个“科技富民强县专项行动计划”试点县（市、区）（以下简称试点县（市））数据，统计分析了我国现阶段县域农业特色产业创新的条件。 2. 在实地调研和五个案例研究的基础上，构建了县域农业特色产业创新情景图，并将其视为县域农业特色产业新技术成果价值的增值过程，从而建立了县域农业特色产业创新模型。 3. 根据县域农业特色产业创新模型，提出了这个价值增值过程中存在的五重链接困境，并根据对专项行动试点工作的成功经验和做法总结，给出了五重链接困境相应的突破路径和十二个典型实例。 4. 从政府推动与市场机制相结合和建立健全县域农业特色产业创新体系角度，提出了相关政策建议。