羊传染性脓疱病毒GIF基因的克隆及序列分析

来源 :内蒙古农业大学 | 被引量 : 2次 | 上传用户:hz_0752
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根据已发表的羊传染性脓疱病毒NZ2株的基因序列,应用计算机程序设计合成一对针对羊传染性脓疱病毒GIF基因的特异性引物,对羊传染性脓疱病毒内蒙分离株OV-nm-05进行PCR扩增,扩增产物与pEASY—T1载体连接,转化至感受态大肠杆菌DH5a中,成功得到GIF基因的阳性克隆,送测序公司进行测序得到该病毒GIF的基因序列。该病毒GIF基因序列长约1280bp左右,其中包括GIF基因的编码区和左右两边的非编码区。应用计算机软件将测定的基因序列及其推导的氨基酸序列与7株参考毒株进行比较。结果表明,内蒙古分离株0V-nm-05碱基序列与OV-NZ2、OV-D1701、OV-IA82、 OV-SAOO、OV-F07.808R、OV-MUK59/05、 OV-F94.848R的同源性分别为95.7%、98.2%、96.7%、95.5%、95.9%、95.5%、95.1%;氨基酸序列同源性分别为95.1%、90.2%、95.1%、94.7%、94.7%、95.1%、93.6%。说明羊传染性脓疱内蒙古分离毒株0V-nm-05的GIF基因与7株参考毒株之间差异不大。
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