2019年12月突如其来的新冠疫情给我国的治理能力带来了严峻的考验。整个疫情防控工作中,全国人民共同抗“疫”,这其中健康码、通信行程卡等数字治理工具发挥了重要的作用。在疫情爆发初期,数字治理工具的加入给我国疫情防控工作带来了新的希望和动力。相关数字治理工具的陆续出现,实现了全国跨省市、跨领域、跨层级、跨部门联动,迅速整合全国的资源和力量,形成一股强大的合力注入疫情防控工作中,极大地提升了我国疫情防控治理效能。通过前期调研与资料查阅,可将数字治理工具在新冠疫情中的治理方式定性为多元主体的“协同治理”。本文看重数字治理工具在新冠疫情防控工作中所释放的治理效能,旨在对新冠疫情防控工作中数字治理工具的协同治理机制进行理论研究,并给数字治理工具在疫情防控中的困境提出有效的优化建议。在此研究目的的指引下,文章共分为七章,分别为——导论、文献综述及理论研究、数字治理工具在新冠疫情防控中的应用、协同治理机制构建、以“健康码”为例的新冠疫情防控数字治理工具案例研究、新冠疫情防控中政府进行数字治理的优化路径建议、结语。本文采用文献研究、案例分析、访谈调查共三种研究方法。首先通过对协同、数字治理工具、新冠疫情等多方面的文献资料进行梳理分析,学习研究协同、整体政府等基础理论。其次,通过对健康码的使用群体的问卷调查数据和对公共部门健康码管理工作人员的访谈,结合网络官方资料,分析出健康码的使用效果和困境。分析发现目前主要存在以下六个方面的困境——获取分析数据精准度不足、数字治理工具标准不兼容、公民隐私泄漏风险、特殊群体的工具应用障碍、系统后台安全问题、公民咨询及反馈不畅问题。随后根据我国新冠疫情防控中数字治理工具的实际应用总结出数字治理工具协同治理机制。整个协同治理机制围绕数字治理工具应用中参与治理的多元主体展开,分别从协同的核心、协同的基础、协同的驱动、协同的保障、协同的目的五个方面作出说明。同时选取北京健康宝、浙江健康码和山东健康通行码三个案例,运用数字治理工具协同治理机制进行嵌入性分析。最终综合前文分析得出新冠疫情防控中数字治理工具应用的优化建议。具体提出数字治理工具协同治理机制的组织架构（包含基础组织架构、网格化协同模式、统筹决策系统三个方面）、规范约束体系（包含法律法规、协同行为规范两个方面）、监督体系与反馈机制（包含监督体系、双向反馈机制两个方面）和内部联动沟通系统（包含互认机制、多元主体信息共享平台两个方面）四个部分的优化建议。目前,有关新冠疫情相关的研究较为丰富,但针对数字治理工具的协同治理机制研究有待继续研究完善,本文的研究尚处于该方面的抛砖阶段,希望本文能对后续研究提供一定的思路。