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珍珠龙胆石斑鱼是一个新的养殖品种,由鞍带石斑鱼(Epinepheluslanceolatus,♂)和棕点石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus,早)杂交而来。优势杂交品种的出现对于养殖业是一大福音,因为通常来说具备杂交优势的鱼类能够展现出较为优越的存活率和产出量,无论在数量上还是质量上都优于亲本。目前未发现珍珠龙胆石斑鱼遗传学研究的报道,为了避免珍珠龙胆有效群体的缩小,保护其种质资源多样性,保证市场上供应的珍珠龙胆苗种质量好、供应量得到保证,因此有必要对珍珠龙胆石斑鱼的群体多样性、遗传分化等方面进行调查研究。本研究结合AFLP标记和微卫星标记技术对四个地区(厦门翔安、漳州东山、山东莱州、海南文昌)的珍珠龙胆养殖群体进行遗传学相关研究,并比较两种标记技术的实验结果,互相验证,旨在给珍珠龙胆养殖群体的种质资源保护和日后的改良育种提供理论依据。研究过程中总共开发出19对微卫星多态性引物,19对引物在30个个体中扩增得到的等位基因数位2-6个;多态信息含量在0.062与0.729之间波动,平均值为0.400;观察杂合度介于0与1之间,平均为0.497;期望杂合度介于0.066和0.731之间,平均为0.415。基于微卫星引物具有通用性的特点将19对引物在四个地区的群体中进行多群体扩增,结果甄选出可以在四个群体中都扩增出条带的15对引物,分析扩增结果表明各群体多态位点比例分别为100.00%(厦门群体),93.33%(山东群体),86.67%(海南群体)和86.67%(漳州群体),总体而言,等位基因个数平均为2.583,有效等位基因数目平均为1.766,香浓信息指数为0.623,无偏(unbiased)期望杂合度平均为0.385,观察杂合度平均为0.470,多态信息含量平均值为0.360;四个群体间的遗传相似度介于0.8573到0.9459之间,遗传距离介于0.0556到0.1539之间。AFLP分析显示四个养殖群体在总体上的等位基因数目平均为1.461,有效等位基因数目平均为1.416,香浓信息指数平均为0.319,无偏期望杂合度平均为0.228,多态位点百分率为平均50.82%。遗传分化研究结果显示四个群体的遗传相似度在0.8520于0.9420之间浮动,遗传距离的范围在0.0600和0.1640之间。比较两种标记技术的结果后,发现在趋势上两种分析结果表现出一致性。