胃癌相关甲基化基因的筛选与鉴定

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实验目的:人类基因的异常改变是癌症发生发展的重要生物学标志之一。近年来研究发现在胃癌组织中常会出现某些特定基因的启动子区的甲基化水平异常。在前期工作中我们发现了在胃癌中可能存在启动子区CpG岛甲基化水平异常改变的10个候选基因,本实验利用基于飞行质谱的高通量CpG位点甲基化程度检测的方法(Mass-Array)和结合亚硫酸盐的测序技术(BSP)的检测方法对候选基因进行了筛选、鉴定和并对其相关功能进行研究。实验设计:通过BSP和Mass-Array方法定性和定量的检测候选基因启动子区CpG岛的甲基化情况。通过实时荧光定量PCR的方法来检测该基因在组织和细胞中的表达水平。最后结合样本的临床资料进行临床相关性分析研究。实验结果:通过研究发现基因DHRS3,短链脱氢酶家族中的一员,在胃癌中作为表观遗传学修饰的目标基因,参与胃癌的发生发展。该基因启动子区的CpG岛在胃癌组织中呈高甲基化改变。BSP和Mass-Array所检测的120例样本中,癌组织与正常组织相比该基因在癌组织中表现出明显的高甲基化改变p<0.0001。且与该基因的mRNA表达成负相关性。在临床相关性分析中发现该基因的改变与胃癌的组织学类型和分化程度密切相关。结论:实验结果表明与正常组织相比在胃癌组织中基因DHRS3启动子区CpG岛呈显著的高甲基化改变,且mRNA表达显著降低,提示该基因在胃癌发生发展中可能起到抑癌基因的作用。该基因启动子区CpG岛甲基化程度的异常有可能在胃癌的早期诊断和预后判断中起到预警分子的作用。
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