拟南芥RNA剪接因子SF1的生物学功能与作用机理研究

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:pgwork2011
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
RNA剪接是基因表达过程中一种重要的基因转录后调控方式,选择性剪接有效地延伸了基因功能的多样性。现有研究表明拟南芥中选择性剪接参与多个生物学过程,如开花时间、昼夜节律、胁迫响应及植物免疫等。但是,剪接过程对叶绿体发育基因的表达调节研究还很少。  通过筛选叶绿体发育缺陷的斑叶突变体thf1的抑制子得到sot4。图位克隆结果表明Suppressor of thf14(SOT4)编码一个保守的剪接因子SF1(splicing factor1)。DNA测序结果表明sot4突变体中该基因的编码序列发生了一个G到A的突变,导致SF1蛋白第198位的甘氨酸替换为精氨酸。在酵母和动物细胞中, SF1/BBP参与内含子分支位点识别与剪接复合体的组装。高通量转录组分析发现拟南芥中AtSF1/SOT4缺失对不同的剪接类型(内含子滞留、外显子跳读、可变5剪接位点和可变的3剪接位点)都有影响,尤其是导致内含子滞留事件明显增加。生物信息学分析表明AtSF1/SOT4偏好识别非典型性的分支位点序列(5-CTWAS-3),体外实验表明AtSF1/SOT4直接结合含有分支位点序列的RNA。酵母中同源蛋白实验表明,SF1G198R突变影响剪接过程中对分支位点上游-1位突变的兼容。AtSF1/SOT4突变引起植物植株矮化、生长迟缓、对ABA抑制萌发响应超敏和耐受干旱等表型,拟南芥异源表达SF1酵母同源蛋白可以互补sot4的生长发育等表型,说明其基本功能的保守性。  转录组表达谱分析发现叶绿体脂质体相关基因的RNA剪接受AtSF1/SOT4调节,观察叶绿体超微结构发现AtSF1/SOT4缺失影响脂质体发育,atsf1-4thf1双突变体中叶绿体发育速度变慢。thf1突变体比野生型积累更多脂质体,表明thf1叶绿体发育也受到脂质体调节。因此,AtSF1/SOT4可能通过脂质体途径调节thf1斑叶形成。另一方面,蛋白质组学分析表明SOT4突变增加叶绿体中翻译相关蛋白含量,暗示SOT4参与影响叶绿体蛋白蛋白翻译过程。  以上实验结果显示AtSF1/SOT4是一个功能保守的剪接因子,在拟南芥中对非典型性的分支位点序列的识别更加重要。AtSF1/SOT4突变影响叶绿体发育,其作用机理有待深入研究。
其他文献
董老师去世了,众人都觉得可惜——董老师六十刚出头,这么年轻就走了,可惜;董老师是在欧洲旅游时突发疾病的,夫妻俩中途结束旅游回国治病.董老师一向勤俭节约,好不容易张罗一
期刊
谁动了我的名表rn孙女士 64岁 退休职工rn[诉说]我和郑丽(化名)是发小,16岁时一起下乡.1977年,我考上大学,成了恢复高考的第一批大学生.当时郑丽已是军人,且提干,前路很宽,所
期刊
机器人小哥rn前两天,我去东京的美国大使馆面签(当面签证).那天,我起了个大早,还精心打扮得文雅清秀,当我长裙飘飘地走进大使馆,首先要过安检.
期刊
单位的办公楼快30年了,房间隔音效果特别差.我的工作间与领导的办公室仅一墙之隔,领导在他屋里接电话,只要声音稍微大点儿,我基本都能听见.
期刊
电力系统短期负荷预测是电力生产部门的重要工作之一,它主要用于预报未来几小时、一天至几天的电力负荷。精准的短期负荷预测结果对电力系统运行的安全性、经济性和供电质量有着重要的保障作用,利用该结果可以经济合理地安排机组启停以减少旋转备用容量,可以合理地安排检修计划以降低发电成本、提高经济效益。短期负荷预测的方法有很多,其中BP神经网络技术是较为先进的预测方法。它能够通过自组织和自适应功能大规模处理各种包
该文采用市场价值法和条件价值法,在收集相关资料和实地调查的基础上,定量研究了2002年广州市帽峰山森林生态系统服务中的固定CO和释放O的价值以及非使用价值,作为对比,还计
采集几个有代表性的青虾地方种群,测定了多种形态学指标,并运用SPSS软件进行统计学处理,比较各地方种群的形态学差异,并计算相互间的遗传距离.结果发现不同水系间和同一水系
老韩一进办公室便气呼呼吐槽:早上坐公交,看到一位女士领着孩子站在自己身旁,她忙起身让座,没想到那位女士让孩子“谢谢奶奶”.一声“奶奶”出口,老韩撞墙的心都有,自尊更是
期刊
配电网中性点的接地方式问题和很多方面都有着密切的关系,如供电可靠性,安全性,绝缘等问题。这些年来,配电网的电缆化率很大程度的升高,这使得网络中的电容电流也随之增加,间歇性弧光接地产生的故障比例增大,为了解决这些问题,提出对中性点接地方式进行改进。随着新兴接地方式的推出,新的问题也随之产生。如何在现有情况下改进单相接地故障模型,并提出更完善的接地方式是值得研究的问题。同时在研究实际工况时发现,当变压
最近,我和野菜杠上了,小根蒜,百姓俗称的“大脑瓜”,我隔几天就买点儿回来,仔细择好,用红辣椒、盐、糖和醋调拌成可口小菜.rn绿莹莹的野蒜苗和红彤彤的辣椒交织在一起,看着就
期刊