论文部分内容阅读
陆地棉许多性状诸如产量、早熟性、抗黄萎病性状及纤维品质等均属于数量性状。目前用于解析数量性状的遗传学方法主要包括基于连锁平衡的QTL定位和基于连锁不平衡的关联分析。本研究将186份陆地棉材料进行两年两个播期的种植,共四个环境下的表型数据结合SSR分子标记通过关联分析的方法挖掘与棉花早衰相关性状(铃重差、上部铃数、倒四叶叶绿素含量)和抗黄萎病性状相关联的SSR位点。主要研究结果如下:1.通过进行遗传多样性分析发现140对SSR引物在186份陆地棉材料中共检测出355个等位变异,平均每对引物的等位变异为2.54。引物多态性信息含量变化为0.503-0.995,平均值为0.759,表明所选引物具有较为丰富的遗传信息。2.利用Structure软件进行群体结构分析可以将186份材料分为2个亚群,每个亚群分别含有96份和90份材料,进一步计算得到每个材料所对应的Q值,用于进行关联分析。3.通过对四个环境下的表型数据结合SSR分子标记选取MLM(Q+K)和GLM(Q)二种模型同时进行关联分析,只含有Q的模型为一般线性模型(GLM),Q+K的模型为混合线性模型(MLM)。通过对结果的分析发现,MLM模型所关联到的位点都是要少于GLM模型。4.将基于140对SSR引物的基因型与186份材料的表型数据进行关联分析,同时采用GLM(P<0.001)模型和MLM(P<0.01)模型。结果如下:1)发现同时存在于两个模型下与倒四叶叶绿素含量相关联的SSR位点有33个,其中能多次检测到的位点有3个,包括NAU998-3、PGML01548-1、CGR5258-3。表型变异解释率分别为6.55%、5.84%、5.93%。2)发现同时存在两个模型下与上部铃数相关联的SSR位点有5个,其中能在两个环境以上同时出现的位点有2个,分别为MGHES-73-1和NAU1230-1。表型变异解释率分别为5.01%和5.21%。3)发现同时存在两个模型下与铃重差相关联的SSR位点有2个,分别为NUA1230-1和NAU1255-1。表型变异解释率分别为5.21%和3.98%4)发现同时存在于两个模型下与抗黄萎病性状相关联的SSR位点有22个,其中能同时在两个环境以上出现的位点有2个,分别为NAU998-3和CGR5258-3。表型变异解释率分别为5.5%和12.1%。5.选取有代表性的96份早熟材料进行遗传多样性分析,遗传相似系数GS介于0.261-0.893之间,平均遗传相似系数为0.482,表明我国陆地棉遗传基础较为狭窄。供试材料可被分为3个亚群,聚类结果和系谱来源存在着一定的相符性。