栉孔扇贝(Chlamys farreri)是我国北部沿海一个非常重要的养殖种类。物理图谱是基因组测序、基因绘图、遗传改良和选育的关键工具。本课题组在BAC文库基础上构建了栉孔扇贝物理图谱,我们采用ABI 3130xl测序仪对两个BAC库总共81,408个BAC克隆进行了指纹分析。经过数据处理,我们最后得到了3,072条contig片段,每个contig平均包含41.2个克隆,平均大小521Kb,所有contig加起来总长度接近1.6Gb,覆盖1.3倍基因组。为了验证物理图谱contig组装的正确性,我们利用BAC-FISH技术将包含栉孔扇贝核苷二磷酸激酶基因(NDPK)的两个BAC克隆定位到染色体同一位置上;而在物理图谱上,这两个BAC克隆也是位于同一条contig上。BAC克隆的共定位结果从一个角度直观地证明了图谱组装的正确性。同时,核苷二磷酸激酶是一类存在广泛、高度保守,在细胞能量和信息传递中具有重要作用的酶,NDPK基因的染色体定位将对深入研究该基因的结构、功能以及应用于生产实践提供理论支撑。物理图谱的构建及低拷贝基因定位工作,将对栉孔扇贝基因组和染色体的深入研究以及图谱整合、染色体鉴别、图位克隆等工作提供重要参考。