【摘 要】
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抗冻蛋白是生物体在进化过程中形成的一类生物抗冻大分子.我们运用分子力学和量子力学两类不同的方法对鱼类抗冻蛋白Ⅱ冰束缚面进行了确认和分析.我们总共设计构建了34个蛋白
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抗冻蛋白是生物体在进化过程中形成的一类生物抗冻大分子.我们运用分子力学和量子力学两类不同的方法对鱼类抗冻蛋白Ⅱ冰束缚面进行了确认和分析.我们总共设计构建了34个蛋白-冰面作用模型.然后,运用分子力学和分子动力学模拟的方法对这34个相互作用的体系进行了几何构型优化和模拟,最后利用半经验量子力学方法AM1和PM3对它们进行单点能量计算.分子力学和量子力学得到的蛋白-冰面之间的相互作用都能表明：由19个氨基酸残基（K37,L38,Y20,E22,Y21,I19,L57,T56,F53,M127,T128,F129,R17,C7,N6,P5,G10,Q1,W11）组成的冰束缚面是抗冻蛋白Ⅱ和冰面最好的相互作用面.同时半经验量子力学计算结果首次给出了关于蛋白和冰相互作用更为细致的微观性质.
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