生态环境损害赔偿磋商制度是对生态环境损害的救济性制度安排。通过赔偿权利人和赔偿义务人签订赔偿协议的方式,实现生态环境公共利益的保护。实现服务于2020年初步在全国范围内构建生态环境损害赔偿磋商制度的目标要求,加强生态环境损害赔偿磋商制度的系统研究和制度设计,具有重要的理论价值和实践意义。首先对其概念进行理论解析。《改革方案》对其法律性质做出界定,将其定性为民事行为并且区别与一般民事行为。磋商只针对生态环境公共利益进行磋商,磋商信息必须公开,赔偿权利人不能放弃权利以及磋商过程需接受第三方监督。生态环境损害赔偿磋商以环境权理论、损害者负担理论和损害赔偿社会化为理论依据,具有填补法律空白、节约司法资源和实现生态正义的功能。其次进行其进行实体设计。从在生态环境损害赔偿磋商制度的原则出发,中应坚持合法、平等自愿、公开以及高效率低风险原则,区分生态环境损害赔偿当事人的权利与义务,明确生态环境损害赔偿的责任,赔偿范围和额度,规定最终签订协议的内容以及以司法确认的方式赋予其效力。最后是对生态环境损害赔偿磋商制度的程序设计。生态环境损害赔偿磋商启动前磋商主体需明确磋商的意愿、生态环境损害事实认定清楚以及完成生态环境损害鉴定评估,解读生态环境损害赔偿磋商的流程。磋商过程中如果出现磋商破裂、在一定期限内未签订生态环境损害赔偿磋商协议以及磋商过程中出现不法行为的情况则磋商中止。为了监督磋商协议的完成情况加入生态环境损害赔偿磋商后评估制度。磋商失败后可以根据主体的不同提起不同的诉讼。