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DNA甲基化在真核生物中是一种重要的表观遗传学修饰方法,也是基因表达调控重要影响因素之一。大量研究结果表明,胞嘧啶DNA甲基化在功能基因表达、细胞分化、X染色体失活、胚胎分化、疾病和癌症发生中都起到非常重要的作用。很多研究表明,不同的甲基化水平可能与组织特异性转录有关,并且对正常的分化和发育至关重要。本研究以猪为研究对象,利用F-MSAP的方法对莱芜猪肌肉、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和胃七个组织进行全基因组DNA甲基化分析,以及对具有不同肉质性状一肌间脂肪含量的我国地方品种莱芜猪和东北民猪,育成品种鲁莱猪、松辽黑猪和军牧一号以及外来品种大白猪的肌肉组织进行全基因组DNA甲基化分析。结果显示,莱芜猪肌肉、心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏和胃七个组织全基因组DNA甲基化程度分别为53.9%,51.2%,50.1%,53.3%,51.9%,51.1%和53.3%；大白猪、莱芜猪、鲁莱猪、军牧一号、松辽黑猪、东北民猪六个品种肌肉组织的甲基化程度分别为47.97%,51.75%,53.21%,50.46%,54.88%,56.98%；采用卡方检验分析不同品种肌肉组织的甲基化程度,结果表明各个品种间的甲基化程度差异显著(P<0.05)。通过数据分析,发现各品种肌肉组织DNA甲基化程度与各品种肌间脂肪含量间不具有相关性。本研究希望通过对猪不同组织和不同品种肌肉组织DNA甲基化的分析,了解猪不同组织和不同品种肌肉的全基因组DNA甲基化水平和组织间DNA甲基化模式差异。为今后猪DNA甲基化的研究积累数据,希望发现和了解甲基化在组织分化过程中的作用,以及通过对具有差异性不同肌间脂肪含量的不同品种肌肉组织全基因组DNA甲基化的测定,揭示是否不同品种肌肉组织全基因组DNA甲基化和肌肉肌间脂肪含量具有相关性,期望发现与肉质性状相关的功能基因,为更好的研究畜禽提供新的思路并奠定基础。