研究背景 登革热是一种近40年来严重影响广东省的急性蚊媒传染病。自2011年以来,登革热在广东发生多次暴发和流行,给人民健康和社会经济造成严重负担。基于病毒遗传信息对登革热精细时空传播特征及关键影响因素的研究,可为登革热暴发疫情的防控措施制定提供科学依据。研究方法 （1）建立登革热等蚊媒传染病在精细尺度的传播链模型:首先建立病例随机组合,获得病例组合间病毒的进化时间、病例间的实际距离;绘制病毒进化时间与距离的关系来测算病例对间随时间、距离来自同一病毒来源的可能性;确定本地区传播链的基本特征。采取相同策略,测算依据人群血清特征数据建立的传播链的特征,确立本地区传播链的基础参数。（2）分析病毒进化时间与空间距离的关系,并估计病例组来自相同传播链的概率:结合病毒进化及病例人群特征数据预测研究目标地区传播链数量,预测传播链内病例对来自同一传播链的概率,使用血清型数据和基因型数据估计有效传播链的数量,测算不同病例对间距离与传播链数量间的相关性。（3）建立基于遗传算法的神经网络模型和随机森林模型,定量分析环境、社会和经济因素对登革病毒进化的影响:考虑不同社区在环境、社会经济和时空传播特征出现的区域异质性,在纳入环境和社会经济等多源数据基础上采用神经网络和随机森林回归模型研究这些因素与病毒进化的相关性,评估模型的拟合效果并应用于风险评估及疫情防控。结果 （1）登革病毒分离测序及分子进化分析揭示从广东省南海里水镇所采集样本分离的病毒具有共同的来源。（2）探讨不同社会及环境因素在分支形成的过程中所发挥的作用,对72种人群、环境及临床检测指标评估发现人群密度、人均收入水平是影响病毒传播的显著因素,而植被、降水的影响不显著。说明精细时空内登革病毒进化受社会因素的影响比环境因素影响更大。登革热病毒的连续传播通常发生在同一社区的家庭之间。地方性、密度依赖性传播和人口密集的社区是病毒多样性的关键来源,居住地是传播的焦点。（3）基于遗传信息的传播链模型表明在广东省南海里水镇,无论病毒在同一个地区的流行时间是6个月、3个月还是1个月,居住地在5公里范围内的病例处于同一传播链的概率随着距离的增加而减小,病例组相距200米范围之内处于同一传播链的概率不受疾病流行时间长短的影响,均在60～70%之间。3个月及1个月的流行时间内病例同处于一个传播链的概率随着距离的增加而下降的趋势要比流行时间为6个月的下降速度更快。基于神经网络和随机森林的模型发现环境、社会和经济因素对登革病毒的进化有一定影响,且基于遗传算法的神经网络模型对于登革病毒的进化的预测具有一定的应用价值。结论 研究结果揭示了精细时空内广东省区县级和街道级本地登革热传播呈时空聚集性,且社会因素而非自然因素是影响登革病毒传播的关键因素。基于遗传信息的传播链模型的研究结果提供了登革热患者居住地在登革热风险中的重要证明,支持了在发现病例的住所周围进行有针对性的媒介控制的重要作用。