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西伯利亚杏是北方半干旱地区重要的生态经济型树种,产量低而不稳的问题为制约产业发展的主要瓶颈,良种选育已成为当务之急。本文以32个西伯利亚杏优选无性系为研究对象,开展了主要经济性状与SSR标记的关联分析,研究了关联位点等位基因的表型效应,在此基础上进行了关联位点基因的表达分析,主要研究结果如下:(1)从合成的600对SSR引物中筛选出155对扩增条带清晰的引物用以进行关联分析,每个位点平均等位基因数(N_A)为5.858,平均有效等位基因数(N_E)为3.412,多态性信息含量(PIC)平均值为0.622,多态性较高。32个供试无性系间遗传相似系数变幅在0.620~0.907之间,平均为0.731,遗传差异较小,亲缘关系较近。(2)利用Structure分析软件将32个西伯利亚杏无性系划分为3个亚群。通过155对SSR引物与13个经济性状间的关联分析,得到了统计学意义上的与经济性状显著关联的49个SSR位点。其中,同一性状与多个位点相关联的性状有12个,表明这些性状由多个基因位点共同调控;同一位点与多个性状相关联的情况有22组,表明这些性状可能存在连锁遗传。(3)分析了49个SSR关联位点等位基因的表型效应,初步明确了西伯利亚杏13个经济性状对应的增效与减效表型效应最大的等位基因,确定了携带果实产量关联位点优异等位基因的典型载体材料为1号、28号和39号无性系,果性状的典型载体材料为81号无性系,核性状的典型载体材料为43号无性系,仁性状的典型载体材料为21号无性系。(4)通过序列比对、PCR扩增检测,共筛选出19个关联位点基因用以进行实时荧光定量PCR;从4个候选内参基因中筛选出18SrRNA作为西伯利亚杏实时荧光定量PCR的最佳内参基因;将实时荧光定量PCR的反应程序由原来的两步反应法改进为三步反应法。(5)关联位点基因表达分析表明,在果实发育过程中19个关联位点基因表达情况可划分为3种类型:总体呈上升趋势,总体呈下降趋势,无规律类型;在不同无性系果、核、仁中检测到的关联位点基因表达量变化规律不同,体现在不同无性系中与果、核、仁大小呈明显正相关、负相关及相关性不明显的位点不同。对于3个无性系,均有在果、核、仁中同时被检测到的相关性明显的关联位点基因,其中X72在3个无性系的果、核、仁中均被检测到。本文初步筛选了19个与果、核、仁性状相关联的位点,为该领域的深入研究奠定了一定基础,也为西伯利亚杏分子标记辅助选择育种提供了借鉴和参考。