当今时代下,我国正处于经济和社会转型的关键时期,国家在发展进步的同时,也面临着各种风险和挑战。自从2003年SARS病毒爆发后,H7N9禽流感、食物中毒、问题疫苗等各类突发公共卫生事件频发,特别是2019年底爆发的新冠肺炎疫情,由于危害严重、影响范围广、持续时间久,不仅严重威胁了广大群众的生命健康,造成了全国范围内的社会和经济混乱,也给政府的应急响应工作带来了巨大挑战。近年来,虽然各级地方政府在突发公共卫生事件应急响应中取得了较大的进展,但依然面临着政府职能“碎片化”、应急资源“碎片化”、参与主体“碎片化”等问题。所以,借助整体性治理理论,分析突发公共卫生事件中地方政府应急响应能力的影响因素是一个重要课题。本文在第一章首先对突发公共卫生事件和整体性治理进行文献综述梳理,说明论文的研究思路和创新点。第二章在厘清突发公共卫生事件、突发公共卫生事件应急响应、突发公共卫生事件政府应急响应能力等核心概念的基础上,阐明整体性理论、危机管理周期理论这两个支撑性理论。第三章分析我国突发公共卫生事件应急管理建设的现状,包括我国突发公共卫生事件应急响应建设的发展历程和面临的各种“碎片化”问题,并构建以职能耦合、资源整备、多元主体协同、信息共享为条件的理论模型。第四章进行突发公共卫生事件应急响应要素机理的联动设计,建立由多个突发公共卫生事件典型案例组成的案例库,并详细阐述设计变量的赋值标准。第五章运用fsQCA（模糊集定性比较分析）方法进行组态分析,得出走向高水平地方政府应急响应的两条平行路径。这两条模式分别是“信息主导型政府应急响应”和“职能—资源型政府应急响应”,接着基于这两种模式分别选取个案进行分析。最后一章提出结论:职能耦合、资源整备、多元主体协同、信息共享这四个因素都不能单独作为政府突发公共卫生事件应急响应的必要条件,政府突发公共卫生事件应急响应背后是多因素的协同作用。本研究对现实实践的启示有:在公共卫生事件突发时,政府可以以信息共享为引擎提升应急响应能力,或以政府职能联动、资源整合为依托提升应急响应能力。