四种常见化脓性感染病原菌的分子检测

被引量 : 1次 | 上传用户:zbc518
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌是常见的化脓性感染病原体,可以引起皮肤、皮下软组织、深部组织的化脓性感染乃至内脏器官的脓肿,也能引起脓毒血症。常对多种抗生素呈不同程度的耐受。在临床检验诊断中,快速准确的检测出病原微生物至关重要。现有的检测方法有分离培养法、免疫学检测法和分子生物学检测方法。目前在临床应用中分离培养法还是菌种检测的金标准,但其耗费时间长,操作繁琐,对检测人员要求较高;免疫学检测法麻较烦需要专门的技术和工具。故本研究从分子生物学角度探索大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌的检测方法,建立了四种病原体的PCR检测体系以及表皮葡萄球菌的LAMP检测。本研究对大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌进行生物信息学分析,筛选出其特异基因。大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌各筛选出基因分别为:LafF(GI:12887815)、TranR(GI:13347275)和 PurE(GI:12329975),表皮葡萄球菌筛选出两个基因为:LysE(GI:3240523)和DeoR(GI:3240916)。针对特异基因设计引物,在单重PCR扩增中,对Mg2+浓度和退火温度进行优化,得到每对引物最佳的Mg2+浓度和退火温度的组合,选择优化好的条件进行扩增,评价检测体系的特异性和灵敏度。利用单重PCR方法对大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌各10株,肺炎克雷伯菌、弗劳地氏枸橼酸杆菌、伤寒杆菌、琼氏不动杆菌、溶血葡萄球菌和摩氏摩根菌各3株进行检测,结果显示只有大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌出现了相应的预期大小的目的条带,其它菌株并未出现任何条带。这表明该检测体系具有非常好的特异性。利用单重PCR方法对大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌分别进行梯度检测,结果显示大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌检测下限可达到2个/反应。这表明该检测体系具有很高的灵敏度。进行多重PCR扩增时,在单重PCR条件优化的基础上,筛选合适的Mg2+浓度和退火温度组合,最终确定50μL反应体系的反应条件为:Taq酶(5U/μL) 0.3μL、dNTP混合物(2.5mM)4μL、10×PCR Buffer 5μL、MgCl2(25mM)3.2μL、四种菌的上、下游引物(10μM)各2μL,反应的退火温度为57℃,延伸时间为20秒。在上述反应条件下,评价此多重PCR检测体系的特异性和灵敏度。反应结果显示大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌均能扩增出目的条带;大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌多重PCR检测的下限为2个/反应。我们还应用LAMP等温扩增的方法对表皮葡萄球菌的DeoR(GI:3240916)基因进行鉴定,通过优化反应条件,建立了LAMP检测体系。最终确定25μL反应体系的反应条件为:Bst酶0.5μL、10×Thermpol 2.5μL、MgCl2(25mM) 4μL、dNTP混合物(2.5M) 4μL,内引物FIP和BIP各2μL、外引物F3和B3各0.5μL、甜菜碱(16mol/L)2.5μL,反应温度为65℃,反应时间为75分钟。反应结果显示只有表皮葡萄球菌出现扩增产物,其它菌种并未出现,表明该环介导等温扩增建测体系有较好的特异性;表皮葡萄球菌的检测下限为2个/反应,表明该环介导等温扩增建测体系有较高的灵敏度。总之,我们通过PCR和LAMP手段对常见化脓性感染病原体大肠杆菌、粪肠球菌、金黄色葡萄球菌和表皮葡萄球菌进行快速检测,检测用基因为首次应用于各自菌种鉴定,建立的检测方法简单、快速、灵敏度和特异性高。
其他文献
河水枯竭、空气污染、树木砍伐、稀有物种濒临灭绝,这些生态破坏,环境恶化的现象层出不穷,并且日益加重。曾经,人类放言要征服地球,而现在地球却在用毁灭性的方式报复着人类
哈尔滨是一个年轻而又历史悠久的城市,其洋气的外表,多元的文化都是我们关注的重点,要想了解哈尔滨地方的文化就不得不提到20世纪初期的哈尔滨。正是这一时期,哈尔滨受多重因
城投公司产生于国务院的新一轮政府投融资体制改革,地方政府不再直接负责基础设施建设,而是将此类建设活动公司化的背景下,特别是在2008年下半年国家“4万亿投资”政策的刺激
自十六大以来,党中央、国务院一直重视以人为本的执政理念,从“三个代表”、“科学发展观”到“中国梦”,治国方针实现了成功转型,即从重经济建设到重视人的发展。具有重要影
起源于美国的翻转课堂,翻转了传统的教学模式、教学理念及师生角色。在借鉴与学习这一新型教学模式时,应重视本土化的研究与实践,尤其要关注实施过程中的种种挑战。
随着信息技术的迅猛发展,信息化建设已成为现代社会各个行业提高自身工作质量、效率及市场竞争力的一大趋势。作为现代人类知识的结晶及关键信息源,推进高校科技档案的信息化
高温超导电缆凭借其通流容量大、线路损耗小、结构紧凑等优点获得了国内外广泛关注,而高温超导电缆通常运行在液氮环境中,一旦发生失超,则会导致运行环境的温度发生剧烈变化,
现代农业庄园已经成为解决农村城镇化的新方式,休闲观光农业是其中一种以农业和农村为载体的新型旅游形态,包括城乡结合部的近郊农业以及远郊、大都市经济圈内适应大都市市场
“中人”只是一个概括性的称谓,自周至清“中人”的具体称谓不断沿革与变化。同被称为“中人”,但在实际的生活中其扮演的角色不同、担当的职能不同。为区别他们的职能分工,
<正>一、雾霾对环境造成的危害雾霾顾名思义是雾和霾两部分组成,雾是由大量悬浮在近地面空气中的微小水滴或冰晶组成的气溶胶系统,而霾则是由空气中的灰尘、硫酸、硝酸等颗粒