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榧树（Torreya grandis）是一种经济价值很高的坚果类树种。本文以来自榧树天然群体的50个母本、每个母本自由授粉子代构建的半同胞家系为研究群体，从母本SRAP标记、半同胞种子性状及其培育的幼苗生长性状、半同胞子代SRAP标记，开展榧树遗传基础研究，旨在为榧树优良种质及新品种选育、苗木培育和香榧产业发展提供一些理论依据。研究结果如下：（1）种蒲（带假种皮的种子）重平均值为8.96g（变幅5.24~12.23g），种核（去除假种皮的种子）重平均值为3.95g（变幅2.30~5.19g）；种蒲横径平均值为2.368cm（变幅1.963~3.018cm），种蒲纵径平均值为2.931cm（变幅2.255~3.685cm）；种核横径平均值为1.762cm（变幅1.438~2.270cm），种核纵径平均值为2.507cm（变幅2.009~3.208cm）；种形指数平均值为0.811（变幅0.695~0.902），核形指数平均值为0.707（变幅0.555~0.823）；出核率平均为值45.15%（变幅34.80~66.49%）。1a生幼苗苗高平均值为19.4cm（变幅9.0~35.0cm），地径平均值为3.61mm（变幅1.56~5.63mm）；2a生幼苗苗高平均值为29.1cm（变幅13.0cm~50.0cm），地径平均值为4.38mm（变幅2.64~6.98mm）；分枝数平均约为7个（变幅1~17）。（2）种子表形各指标在半同胞家系间均存在极为显著的差异（p<0.01），18号母本产生的种子最大，15、36和49号母本产生的种子最小；种子形状最为细长的是25号母本的种子，35、36、46、47和80号母本产生的种子则较圆。21号母本种子的出核率最低，最高的是36号。（3）种子表形指标两两之间极显著正相关（p<0.01），种蒲和种核的形状与重量的关系无规律；不同年龄幼苗的生长性状两两之间极显著正相关（p<0.01）；种蒲越重则幼苗苗高和地径生长越快；种蒲和种核的横径越大，则苗高生长越快，而种蒲的纵径与幼苗生长无相关性，幼苗分枝数和种子表形也无相关性。（4）母本所在群体的遗传多样性不高，Nei s基因多样性（H）和Shannon信息指数（I）分别为0.1666、0.2623。D值衡量两两显性标记位点之间连锁不平衡（LD）的大小，最小的组合为S18-18和S18-26，为-0.073；最大的组合为S18-18和S18-27，为0.159；平均0.014，标准差0.018。存在显著LD的组合共有300个（p<0.05），占所有组合的1.11%；极显著的组合20个（p<0.01）。说明榧树半同胞子代群体内无明显的亚结构，多样性较丰富。（5）23个SRAP标记位点与1a生幼苗苗高显著相关，这些位点解释了~27.036%的变异；6个标记位点均与2a生幼苗苗高极显著关联，解释了~12.330%的变异；未能发现与1a生幼苗地径显著关联的SRAP标记，只有1个SRAP标记与2a生幼苗地径显著关联，贡献率为1.351%；与2a生幼苗分枝数相关联的SRAP标记有15个，其中4个极其显著，解释了~20.855%的变异。发现3个标记S57-13、S92-19和S18-18分别与1、2a生幼苗苗高及2a生幼苗分枝数关联极显著；标记S28-12、S92-19与1、2a生幼苗苗高及2a生幼苗分枝数均显著关联；S97-22与1a生幼苗苗高及2a生幼苗分枝数显著关联。