胃癌环状RNA表达谱研究及其功能分析

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目的:筛选并鉴定胃癌circRNA表达谱,分析circRNA的生物学功能。方法:体外培养人低分化胃癌细胞MGC-803、人中分化胃癌细胞SGC-7901、人高分化胃癌细胞NCI-N87和人正常胃上皮细胞GES-1,利用circRNA基因芯片技术检测胃癌细胞和正常胃黏膜上皮细胞中差异表达的circRNAs,利用qRT-PCR技术对部分差异表达的circRNAs进行验证,使用Cytoscape软件构建circRNA-miRNA-mRNA网络图,对下游靶基因进行GO分析和KEGG Pathway分析。结果:与人正常胃黏膜上皮细胞相比,在不同分化程度的人胃癌细胞中,表达上调的circRNA为79个,表达下调的circRNA为229个。PCR结果提示hsacircRNA103571在正常细胞中明显高于肿瘤细胞,GO分析提示hsacircRNA103571间接调控的靶基因在分子功能方面,主要集中在结合蛋白、调节蛋白激酶活性等方面;在细胞组分方面,主要集中在细胞内细胞器方面;在生物学过程方面,主要集中在参与细胞蛋白质修饰等方面。KEGG Pathway分析提示hsacircRNA103571可能通过Ras信号通路、FoxO信号通路、Hippo信号通路以及mTOR信号通路参与胃癌发生发展。结论:在胃癌细胞中,hsacircRNA103571是抑癌基因,其机制可能是与hsa-miR-16-5p相互作用,通过Ras信号通路、Hippo信号通路等多条信号通路参与胃癌的发生发展。
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