苍南县政府污水治理项目是落实温州市委市政府建设“美丽浙南水乡建设”战略部署的重要组成部分,同时也是一项惠及千家万户的民生工程。苍南县政府高度重视污水治理项目,逐年投入专项资金用于污水治理工程,然而我们发现污水治理项目在政策执行中问题逐步显现,污水治理专项资金的预算绩效管理也存在着诸多问题,为了更好地确定下一阶段项目实施的具体政策方向,紧迫需要掌握专项资金实施的整体和系统效果。因此污水治理专项资金的预算绩效管理工作的重要性日益凸显出来。本文紧紧围绕苍南县政府污水治理专项资金预算绩效管理展开研究,运用政府预算绩效的相关理论,通过理论和实证相结合的方法,全面总结分析浙江省苍南县污水治理专项资金预算绩效管理改革实践,从污水治理专项资金立项的背景、专项资金的资金使用情况和计划完成情况,深入剖析苍南县污水治理专项资金预算绩效管理现状,并依据现状分析当前预算绩效管理存在的问题,在总结国内外政府专项资金预算绩效管理实践经验的基础上,提出改进苍南县污水治理专项资金预算绩效管理的有效合理建议,为苍南县推进专项资金的预算绩效管理改革提供理论指导。论文从绩效理念、资金的分配、资金使用、绩效评价等方面深入解析存在问题的根源,从强化污水治理专项资金的预算绩效管理理念、提高污水治理专项资金的资金管理水平、加强污水治理专项资预算绩效的全过程管理和提高污水治理专项资金预算绩效评价水平等方面提出加强污水治理专项资金预算绩效管理的对策与建议,为苍南县其他类型专项资金的预算绩效管理提供借鉴,促进专项资金预算绩效管理经验在浙江省内或国内同类型、同级别的地方县市区进行推广,为当前政府实施的专项资金预算绩效管理改革提供有益的参考。