全球企业并购重组业务最早发生于20世纪的美国,距今已经有一百多年。中国的企业重组,发展较为滞后,最早开始于深宝安收购延中实业,至今只有二十多年的历史。企业重组业务不仅可以帮助企业实现战略,还通过资源再分配实现资源最佳利用,企业可以通过并购重组来实现降低生产成本、扩大市场份额、实现多元化经营、剥离亏损业务等目的,使企业在行业内处于领先地位。现阶段我国经济发展速度放缓,我国面临产业转型、资源重新配置等问题,可能将会迎来新一轮的企业并购重组热潮。企业并购重组属于交易复杂、金额巨大、税负较重的非日常经济活动,税收成为影响企业重组交易的重要因素。并购重组业务需要我国政府制定一系列税收优惠政策减轻交易各方税收负担,激励法人股东与自然人股东参与企业重组交易的积极性。在创新创业背景下,我国制定相关税收优惠政策以鼓励企业重组发展,其中国家税务总局发布财税[2009]59号文件中规定一般税务处理方式和特殊税务处理方式,符合规定条件的企业重组交易,法人股东可以采用特殊性税务重组税务处理方式,非现金支付部分可以递延纳税,极大的降低企业重组中法人股东税收负担。但是在个人所得税政策上却没有类似的税收优惠。现今经济形式发展日益丰富,有不少企业的初始创业者或者大股东是自然人,因此越来越多自然人参与到企业重组交易中,但是所得税政策的不协同会阻碍企业重组的进程。本文在详细阐述企业重组相关理论基础上,针对不同的涉税环节,详细分析自然人股东参与企业重组交易相关个人所得税政策的演进,从理论上分析企业重组自然人股东所得税纳税困境。其次,从北纬通信重大企业重组案例切入,分析企业重组个人所得税税务处理以及最终失败的原因,揭示完善企业重组个人所得税的必要性。并针对导致企业重组自然人股东纳税困境原因及造成的消极影响,从企业重组个人所得税政策、自然人股东事前进行筹划、完善个人所得税税收征管制度等方面提出改进建议。本文的研究主题是企业重组个人所得税导致自然人股东所得税纳税困境,运用案例分析与理论结合的方法。主要探索破解企业重组自然人股东所得税纳税困境的路径。