大鼠卡氏肺孢子虫DHFR和DHPS基因序列的测定与同源性分析

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目的:分析我国重庆大鼠卡氏肺孢子虫的二氢叶酸还原酶(DHFR)和二氢叶酸合成酶(DHPS)基因的序列特性,应用PCR限制性片段长度多态性(PCR—RFLP)技术分析DHPS基因的变异。 方法:(1)用地塞米松磷酸钠注射液腹股沟皮下注射的方法,用SD大鼠建立肺孢子虫肺炎动物模型。(2)实验分组:正常对照组(正常大鼠),阴性对照组(给磺胺药的正常大鼠),阳性对照组(建立Pc模型未给磺胺药的大鼠)和实验组(建立Pc模型并用磺胺药治疗的大鼠)。(3)肺组织印片六亚甲基四胺银染色观察卡氏肺孢子虫(Pneumocystis carinii,Pc)包囊,肺组织切片苏木素—伊红(hematoxylin—eosin,HE)染色观察其病理变化。(4)收集大鼠的肺组织,提取DNA,用PCR方法扩增卡氏肺孢子虫的DHFR和DHPS基因,纯化扩增产物后测序。检索基因文库(Gene bank,gb),进行同源性分析。(5)用AccⅠ和HaeⅢ两神酶对DHPS基因的PCR扩增产物进行酶切,并应用PCR—RFLP技术对其进行分析。 结果:(1)实验组和阳性对照组大鼠全部感染Pc,正常对照组和阴性对照组未发现Pc。(2)实验组和阳性对照组的Pc DHFR和DHPS基因PCR扩增均呈阳性,阴性对照组和正常对照组无扩增。实验组和阳性对照组Pc DHFR有832个碱基,与gb[M26495](Pc f.sp. rat)序列比较,同源性均为99%,与gb[AF322061](Pc f.sp. rat)序列比较,同源性均为100%。实验组大鼠Pc DHPS基因有816个碱基,与gb[U66283](Pc f.sp。muris)、gb[U66282](Pc f.sp. hominis)序列比较同源性分别为94%和83%。阳性对照组Pc DHPS基因序列有839个碱基,与gb[U66283]、gb[U66282]序列比较同源性分别为95%和84%。(3)通过限制性内切酶AccⅠ和HaeⅢ酶切电泳,应用PCR—RFLP技术分析实验组和阳性对照组大鼠Pc DHPS基因并未发现Ala55/Ser57位点的突变。 结论:(1)地塞米松磷酸钠皮下注射法是一种建立SD大鼠肺孢子虫肺炎动物模型的良好方法。(2)实验组和阳性对照组Pc DHFR和DHPS基因的PCR扩增均呈阳性,两个基因与Gene bank内相应的基因序列同源性较高。(3)PCR具有灵敏性好、分辨率高、重复性好、操作简便、快速等优点,适用于肺孢子虫肺炎的分子生物学诊断。(4)进行PCR—RFLP分析后发现我国重庆SD大鼠源肺孢子虫的DHPS基因为野生型。
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