我国作为世界上剩余水能开发潜力最大的国家，拥有全球近20％的尚未开发的水力资源，我国水电消费量占全世界水电消费量的25%左右，已经成为世界第一水电开发/消费大国。我国国民经济和社会发展第十二个五年（2011－2015年）规划纲要中明确提出推进能源多元清洁发展，在做好生态保护和移民安置的前提下积极发展水电，重点推进西南地区大型水电站建设，我国水电开发处于重要黄金发展期。水力发电企业作为水电开发和运营的主体，其经营效率高低不仅影响自身企业发展，对于电力行业改革是否得以有序进行也有着及其深远影响，效率就其含义而言是在业务活动中投入与产出或成本与收益之间的对比关系，从本质上来讲，它是其资源有效配置、市场竞争能力、投入产出能力和可持续发展能力的总称。　　本文通过结合国内外研究现状和水力发电企业特点，构建我国水力发电企业效率总体评价流程、效率评价指标和效率评价模型，并通过相关性分析方法对效率评价指标体系进行了检验，在此基础上通过使用DEA(数据包络分析法)和Malmquist指数进行科学客观量化分析，从而为水电企业效率评价提供科学的依据。同时本文以长江电力股份有限公司为例，通过DEA模型分析，对长江电力股份静态投入产出效率和动态投入产出效率进行了分析，并对企业投入冗余和产出不足问题进行了研究，分析结果表明我国水力发电企业投入产出效率较高，处于较好的投入产出区间内，但也存在投入冗余与产出不足，尤其是装机容量与发电量产出不足问题，对于我国水力发电企业如果更好实现装机容量与发电量投入产出的效益的最大化，是当前我国水力发电效率提升的关键。文章最后基于模型分析结果进行了讨论，在此基础上提出了相关建议，对我国水力发电企业效率的提升有一定的参考价值。