村镇银行作为新型农村金融机构,近年来的发展如火如荼。村镇银行能够弥补我国农村地区金融服务不足的缺口,有利于缓解我国农村地区金融排斥现象,有利于提高我国金融包容水平。但在近十年的村镇银行发展历程中,也存在着一些由外部环境或内部治理等方面的因素造成的问题,如村镇银行分布过于集中,村镇银行规模较小等。经营效率是衡量村镇银行发展状况的一种指标。为此有必要对村镇银行的经营效率进行研究以厘清这几种外部或内部因素对村镇银行的发展有什么程度的影响,为村镇银行的探索发展之路提供有益的建议和启示。影响村镇银行经营效率的因素在宏观经济层面上主要是地区经济水平和宏观经济政策,在中观行业层面上主要是同业竞争情况和行业政策制度,在微观企业层面上主要是股权结构、资产规模、人员配置和业务覆盖面。其中微观层面的因素是三个层面中影响村镇银行经营效率最直接也是最有影响力的。通过对上述主要影响因素的分析建立相应指标体系,将收集到的16家村镇银行经营数据运用DEA方法的CCR模型、BCC模型和超效率模型进行分析,发现与村镇银行期望在经济发达地区能获取更高经营效率的预期相悖,影响村镇银行经营效率的主要因素并不在于外部环境,而在于内部治理,特别是资产规模的合理性。因此,对村镇银行的发展,在宏观层面上,国家应通过宣传改变村镇银行地区偏见,并采取地区差别政策引导村镇银行回流经济落后地区;在中观层面上,行业应促进村镇银行同业间交流学习,建立同业风险基金机制,强化村镇银行风险承受能力;在微观层面上,银行自身应合理调整规模,加强风险控制,发展多种业务,实现经营业绩质与量的同步提高,从而实现更好发展。